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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » Sybyl做QSAR中网格间距的问题
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BBQY

铁虫 (小有名气)

[求助] Sybyl做QSAR中网格间距的问题

请教一下，在用sybyl做QSAR中，三维网格的间距怎样可以调整呢？默认的是2A，怎样调整为1A呢？
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1楼 2013-01-10 19:41:26
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迷你11012

银虫 (小有名气)
当你填充autofill columns时，出来的add new CoMFA Column对话框中有个Regionl栏目，选择use existing region 自己命名一个，然后点击Define就会出现相关的参数设置了，在里面就可以修改了。
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只要你有勇气和信心，没有战胜不了的困难。
5楼2020-11-02 17:51:51
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BBQY

铁虫 (小有名气)
可能是上面的问题不够清楚，我再具体问一下。3D-QSAR的原理是把叠合好的小分子放在一个三维空间的网格中，这个网格会被分为很多小格子，探针在每个格点处探测与小分子的相互作用。用sybyl做QSAR的时候，这个三维空间的网格间距默认是2A，怎样可以调整这个网格间距为1A呢？
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2楼2013-01-14 10:01:17
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zhouzhiguang

金虫 (小有名气)
★ ★
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2013-01-15 10:32:38
做qsar的话只用叠合原理是不够的。一定要和对接结合起来做的

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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让我们high起来！
3楼2013-01-14 22:40:36
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BBQY

铁虫 (小有名气)
构象我已经选好了，我只是想改变一下网格间距这个参数，看看结果有什么差别。这个参数要怎么调整呢？
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4楼2013-01-15 09:10:36
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