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liying2010B银虫 (小有名气)
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[求助]
请教：代谢组学数据预处理结果里各英文参数的意义？
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本人采用XCMS-online 对GC-MS数据预处理，因为是新手，结果里各英文参数的意义很多都不知道是什么含义，且该选其中的哪几个进入下一步分析呢？ 参数分别为：featureidx name METLIN_MSMS fold pvalue mzmed rtmed maxint dataset1_mean dataset2_mean isotopes adducts peakgroup usernotes tstat qvalue fscore mzmin mzmax rtmin rtmax dataset1_sd dataset2_sd 特来向各位代谢组学的高手们请教，还望大侠们不吝赐教一二，小女子感激不尽！如有需要，好的答案我在手动追加金币也可以呀！这个月要出结果，着急呀，好心的您快来帮帮我吧！     |
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 气质实验及数据处理 |
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【答案】应助回帖
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wizardfan: 金币+1, 谢谢参与 2013-01-21 06:16:15
liying2010B: 金币+20, ★★★★★最佳答案, O(∩_∩)O谢谢，特别欢迎你来回帖哦！ 2013-01-21 12:54:22
wizardfan: 金币+1, 谢谢参与 2013-01-21 06:16:15
liying2010B: 金币+20, ★★★★★最佳答案, O(∩_∩)O谢谢，特别欢迎你来回帖哦！ 2013-01-21 12:54:22
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xcms给出的excel表中 有用的参数分别是 name，mzmed （质荷比） ，rtmed（出峰时间）这几个，还一个峰面积的参数（你所给的众多参数中没看到） 这些数据是归属于每个质谱峰（或称为碎片峰）的（可能有好几百个质谱峰，但实际上色谱峰是几十个，这是因为色谱-质谱仪器每个色谱峰至少有3到5次的扫描，质谱间隔也有若干次扫描。） 先按照rtmin的出峰时间，从小到大把execl表中每一行排列好 然后出峰时间有效位数前三位几乎一样的那些质谱峰，很大可能来源于同一个色谱峰（每个色谱峰代表一种生物标志物） 在质谱工作站中，把色谱峰的质谱信息和这些质谱峰的质荷比相比较，确定哪些质谱峰是属于同一个色谱峰，然后把它们峰面积相加。 |
8楼2013-01-19 13:14:33