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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » RMSD跑不平
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lmzxcom1

金虫 (著名写手)

[求助] RMSD跑不平

用AMBER8.0，跑一个蛋白质，RMSD一直跑不平啊，30ns了啊。大侠们出出主意吧
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amber

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1楼 2013-01-09 18:59:36
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piaoluodeyu

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2013-01-10 08:55:15
不一定要很平的 有波动很正常
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3楼2013-01-10 08:48:02
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mengyan142

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2013-01-09 20:32:16
我的跑了100ns 都不是很平， 你把结果贴出来，看有多不平啊？
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2楼2013-01-09 19:12:45
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yaozhq

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lmzxcom1: 金币+5 2013-01-10 15:36:45
看波动大小 跑成直线是不现实的  体系会有规律性的振动
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4楼2013-01-10 10:06:56
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