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itismineok捐助贵宾 (正式写手)
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[交流]
建议开设《计算物理、化学、生物、材料》的板块
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关于板块的名称：《计算物理、化学、生物、材料》 总觉得计算化学这个名字把搞物理，材料，生物的人都拒之门外了，所以将名字再次改为《计算物理、化学、生物、材料》，特此声明！ 包含的研究方向：QM计算，MD计算，Ab Initio MD计算，QM/MM计算。 板块：包括 理论，软件，应用 三个子版 理论 QM计算，MD，Ab Initio MD，QM/MM方法的基本原理，最新进展。 软件 软件开发，常用软件介绍： 比如 量化软件：Gaussian0X, GAMESS,ADF,ABINIT,MOPAC等。 分子动力学软件：Amber, NAMD,Gromacs,Charmm 等。 从头算MD软件 ：CPMD 应用： 介绍各种计算的实例，涵盖以下各领域： 计算物理 计算化学 计算生物 计算材料 运作方式： 管理人员：编辑（版主） 主要负责版规草拟和实施，约稿，初审稿件，日常管理 荣誉类人员：审稿人，专栏作者 审稿人：由发稿人推荐或者由编辑提供，负责对稿件的评审 专栏作者：受编辑多次约稿的作者，并有多篇优秀稿件 欢迎大家来拍砖！ [ Last edited by itismineok on 2007-8-29 at 11:15 ] |
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- 专业: 科学计算
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科学计算是当今科学研究的中除理论和实验外的第三种方法,目前在国际上得到广泛的关注和重视. -------参见<<计算科学：确保美国的竞争力>>[美国总统报告] 在科学计算的共性问题上实质需要计算数学方向深入研究科学计算理论算法,建立理论计算体系和实现技术, 这是核心问题,我们应用具体软件时必须对软件的核心算法有所了解,否则难以实现高水平,创新性高的研究成果; 目前国内对此认识不足,只是低层次的软件的应用, 实际上是简单的应用,甚至连简单的二次开发也没有. 因此,本版块的建立要立足科学计算问题的基础,逐步帮助大家提高对科学计算核心问题的认识, 这是渐进的过程,打基础的过程,必须做起来的, 但是很现实地估计,这是出力不讨好的工作. 从长远来看, 我们应该具有这样的认识和点点滴滴的行动. 在各个一级学科层面上, 包含了计算物理,计算力学,计算化学,计算材料学,计算量子力学,计算生物学,等等, 虽然具体的研究内容不一样, 但是在计算理论方法上都可以在计算数学理论框架上找到共同的基础. 因此重新建立一个科学计算斑块,在斑块下在分计算物理,计算力学,计算化学,计算材料学等具体子问题. 从具体应用层面上,我们用的最多的是各种软件,而每种软件往往局限在某类问题上, 会用的人通常在国内并不多, 统一在每个学科内比较好, 如计算材料方面的软件,统一在版块的计算材料学内比较好. 从整体的科学计算的共性问题, 到某些一级学科的计算问题, 在到具体的软件应用层面, 分层次, 从基础到应用, 可能更好一点, 这是本人的一点意见. |
52楼2007-12-01 21:43:39
2楼2007-08-01 22:36:48
itismineok
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- 专业: 生物大分子结构与功能
3楼2007-08-02 08:20:39
yalefield
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- 虫号: 96063
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- 专业: 高等教育学
- 管辖: 计算模拟
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计算化学领域的名词、概念由于变化较快，往往产生误会。 1、有一本《计算化学》的书，而内容却是“化学计算” 2、分子模拟，最早的概念其实是“分子图形学”，后来才逐渐演变为动力学 3、举一个例子：计算化学邮件列表（CCL.net）在2004年间，由于关于高斯的帖子的确很noisy，因此要求所有关于高斯的主题，都冠以G:，这样，就减少了对非高斯粉丝的打扰。 4、再举一个例子： 美国化学会关于计算化学的文章，主要有以下期刊： （1）J Chem Inf Model: 化学信息与模拟 （2）J Phy Chem A（以及B和C）：物理化学 （3）J Chem Theory Comput: 化学理论与计算 其他的则分布在J Med Chem等，与具体领域比较密切。 而欧洲则有： JCC: 计算化学 QSAR & Combi Chem: 构效关系与组合化学 等 5、因此，如果为“分子模拟”开版，那要不要为“计算化学”、“量子化学”、“分子力学”、“化学信息学”、“化学计量学”开版？ 建议： 1、参考国家自然科学基金委员会关于课题研究领域的分类 2、建议参考美国化学会、中国化学会等关于专业委员会的分类 ----------------------------- （1）美国化学会的专业分组 （2）中国自然科学基金委员会化学科学部学科代码 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=540484&fpage=1 [ Last edited by yalefield on 2007-8-2 at 10:58 ] |
4楼2007-08-02 10:33:45