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itismineok

捐助贵宾 (正式写手)

[交流] 建议开设《计算物理、化学、生物、材料》的板块

关于板块的名称：《计算物理、化学、生物、材料》

总觉得计算化学这个名字把搞物理，材料，生物的人都拒之门外了，所以将名字再次改为《计算物理、化学、生物、材料》，特此声明！

包含的研究方向：QM计算，MD计算，Ab Initio MD计算，QM/MM计算。

板块：包括 理论，软件，应用 三个子版
理论
QM计算，MD，Ab Initio MD，QM/MM方法的基本原理，最新进展。

软件
软件开发，常用软件介绍：
比如    量化软件：Gaussian0X, GAMESS,ADF,ABINIT,MOPAC等。
分子动力学软件：Amber, NAMD,Gromacs,Charmm 等。
从头算MD软件 ：CPMD  

应用：
介绍各种计算的实例，涵盖以下各领域：
计算物理
计算化学
计算生物
计算材料

运作方式：
管理人员：编辑（版主）
主要负责版规草拟和实施，约稿，初审稿件，日常管理

荣誉类人员：审稿人，专栏作者
审稿人：由发稿人推荐或者由编辑提供，负责对稿件的评审
专栏作者：受编辑多次约稿的作者，并有多篇优秀稿件

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[ Last edited by itismineok on 2007-8-29 at 11:15 ]
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1楼 2007-08-01 21:40:47
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
计算化学领域的名词、概念由于变化较快，往往产生误会。

1、有一本《计算化学》的书，而内容却是“化学计算”
2、分子模拟，最早的概念其实是“分子图形学”，后来才逐渐演变为动力学
3、举一个例子：计算化学邮件列表（CCL.net）在2004年间，由于关于高斯的帖子的确很noisy，因此要求所有关于高斯的主题，都冠以G:，这样，就减少了对非高斯粉丝的打扰。
4、再举一个例子：
   美国化学会关于计算化学的文章，主要有以下期刊：
   （1）J Chem Inf Model: 化学信息与模拟
   （2）J Phy Chem A（以及B和C）：物理化学
   （3）J Chem Theory  Comput: 化学理论与计算
   其他的则分布在J Med Chem等，与具体领域比较密切。
   而欧洲则有：
   JCC: 计算化学
    QSAR & Combi Chem: 构效关系与组合化学
   等

5、因此，如果为“分子模拟”开版，那要不要为“计算化学”、“量子化学”、“分子力学”、“化学信息学”、“化学计量学”开版？

建议：

1、参考国家自然科学基金委员会关于课题研究领域的分类
2、建议参考美国化学会、中国化学会等关于专业委员会的分类
-----------------------------
（1）美国化学会的专业分组
（2）中国自然科学基金委员会化学科学部学科代码
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=540484&fpage=1

[ Last edited by yalefield on 2007-8-2 at 10:58 ]
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4楼2007-08-02 10:33:45
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cl子鱼

铜虫 (小有名气)
赞同,可以学习分子模拟软件,很高兴
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2楼2007-08-01 22:36:48
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itismineok

捐助贵宾 (正式写手)
这个帖之子不要沉了，我可是很有诚意的，顶上去！
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3楼2007-08-02 08:20:39
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itismineok

捐助贵宾 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by yalefield at 2007-8-2 10:33 AM:
计算化学领域的名词、概念由于变化较快，往往产生误会。

1、有一本《计算化学》的书，而内容却是“化学计算”
2、分子模拟，最早的概念其实是“分子图形学”，后来才逐渐演变为动力学
3、举一个例子：计算化 ...

非常感谢你的指点，我希望开设这个板块能够吸纳：
量化计算
分子动力学模拟
两方面感兴趣的朋友，我自己主要是作分子动力学模拟的，用量化软件做QM／MM计算！
赞一下 回复此楼
5楼2007-08-02 11:26:02
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