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yuyuping121铜虫 (小有名气)
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[求助]
用Ambertool转换小分子力场时出错
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[root@localhost 6]# antechamber -i 9.out -fi gout -o 9.mol2 -fo mol2 -c resp Info: the atom number exceeds the MAXATOM, reallocate memory automatically Info: the bond number exceeds MAXBOND, reallocate memory automatically Info: the atom number exceeds the MAXATOM, reallocate memory automatically Warning: the assigned bond types may be wrong, please : (1) double check the structure (the connectivity) and/or (2) adjust atom valence penalty parameters in APS.DAT, and/or (3) increase PSCUTOFF in define.h and recompile bondtype.c Be cautious, use a large value of PSCUTOFF (>100) will significantly increase the computation time Error: cannot run "/usr/local/amber11/bin/bondtype -j full -i ANTECHAMBER_BOND_TYPE.AC0 -o ANTECHAMBER_BOND_TYPE.AC -f ac" in judgebondtype() of antechamber.c properly, exit 高斯文件正常结束的，结构我看看也没什么问题啊，就是出错，求高手指点？？ 我的分子只有C H O N 不过有300个原子 |
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