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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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linkfuture

[交流] 做系统发育研究,哪种分子标记更具优势

该动物的所属科内的核酸序列都是未知,也就是说不能参考亲缘关系进的物种来设计引物,通过直接测序 序列比对来做系统发育研究,剩下的方法只有ITS ISSR RAPD这些分子标记了,那么哪种更有优势呢,或者还有一些比较经济的方法...
想听听前辈 虫虫的意见

[ Last edited by linkfuture on 2007-8-1 at 16:57 ]
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linkfuture

我在开题,一头雾水啊,关键是老板的专长是生态,不是分子,(我们这几届作系统发育的算是吃螃蟹了)一切都靠自己了,在+四处问医吧.....
不知2楼的虫子现在什么状态.有机会交流下
3楼2007-08-03 20:50:55
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honinglee

木虫 (正式写手)

我们这里有做过  杨树   系统进化 的一个前辈博士。
看过文献,好象用ITS的多些
RAPD能应用的分类阶元低
天下事有难易乎?为之,则难者亦易矣;不为,则易者亦难矣。
2楼2007-08-03 18:19:24
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guo1983752

银虫 (初入文坛)


johnsooh(金币+1,VIP+0):说的不错,RAPD虽然可以广泛分析未知序列物种,但重复性不高,这的确是研究的麻烦, 还是同意guo1983752建议,通过设计兼并性引物, 克隆测序以得到准确的序列信息,如果序列太长可以使用 RACE
1 可以用通用引物扩增,再从得到的条带中筛选、测序、设计新引物
2 RAPD可以用于没有任何背景的序列的研究,但是重复性差、操作要求严格。RAPD标记可以进一步转化为SCAR标记。这一类的文献很多
4楼2007-08-18 09:17:37
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signal023

荣誉版主 (知名作家)

No stupid question, no q .

优秀版主

好象一般用的是ITS分子标记,不过该标记也只能用于低水平系统演化分析!
欢迎常来“出国留学区”!
5楼2008-06-30 17:51:43
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