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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 做系统发育研究,哪种分子标记更具优势
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linkfuture

[交流] 做系统发育研究,哪种分子标记更具优势

该动物的所属科内的核酸序列都是未知,也就是说不能参考亲缘关系进的物种来设计引物,通过直接测序 序列比对来做系统发育研究,剩下的方法只有ITS ISSR RAPD这些分子标记了,那么哪种更有优势呢,或者还有一些比较经济的方法...
想听听前辈 虫虫的意见

[ Last edited by linkfuture on 2007-8-1 at 16:57 ]
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1楼 2007-07-31 20:49:02
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honinglee

木虫 (正式写手)
我们这里有做过  杨树   系统进化 的一个前辈博士。
看过文献，好象用ITS的多些
RAPD能应用的分类阶元低
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天下事有难易乎？为之，则难者亦易矣；不为，则易者亦难矣。
2楼2007-08-03 18:19:24
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linkfuture

我在开题,一头雾水啊,关键是老板的专长是生态,不是分子,(我们这几届作系统发育的算是吃螃蟹了)一切都靠自己了,在+四处问医吧.....
不知2楼的虫子现在什么状态.有机会交流下
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3楼2007-08-03 20:50:55
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guo1983752

银虫 (初入文坛)
★
johnsooh(金币+1,VIP+0):说的不错,RAPD虽然可以广泛分析未知序列物种,但重复性不高,这的确是研究的麻烦, 还是同意guo1983752建议,通过设计兼并性引物, 克隆测序以得到准确的序列信息,如果序列太长可以使用 RACE
1 可以用通用引物扩增，再从得到的条带中筛选、测序、设计新引物
2 RAPD可以用于没有任何背景的序列的研究，但是重复性差、操作要求严格。RAPD标记可以进一步转化为SCAR标记。这一类的文献很多
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4楼2007-08-18 09:17:37
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signal023

荣誉版主 (知名作家)

No stupid question, no q .

优秀版主
好象一般用的是ITS分子标记，不过该标记也只能用于低水平系统演化分析！
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欢迎常来“出国留学区”！
5楼2008-06-30 17:51:43
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schkk

至尊木虫 (正式写手)
试试AFLP，这种标记技术是不需要事先知道特种的基因组信息的，应该很适合你
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6楼2008-07-03 00:48:17
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glenn_007

木虫 (小有名气)
我现在在做ITS和ISSR
ITS区分的不好，只有几个碱基差异；ISSR很烦，需要耐心摸索条件。
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7楼2008-07-03 15:48:04
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