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lei234

新虫 (小有名气)

[交流] IRC

IRC分析用了forward 和reverse ,产物可以得到，可是反应物就是得不到，步长调为25、 15都不行，分子结构基本上没有变，maxcycle=100也没有用肿么办、、、、
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1楼 2013-01-04 10:30:26
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lei234

新虫 (小有名气)
可是亲，过渡态是在要断的键和新生成的键之间振动的呀...
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4楼2013-01-04 15:29:33
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t13340033021

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
lei234(金币+2): 谢谢参与
gmy1990: 金币+2 2013-01-04 22:03:06
虚频找错了亲，只是产物的虚频振动而已
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3楼2013-01-04 11:49:01
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ryxiao

禁虫 (小有名气)
★
lei234(金币+2): 谢谢参与
本帖内容被屏蔽
5楼2013-01-04 19:06:39
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t13340033021

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by lei234 at 2013-01-04 15:29:33
可是亲，过渡态是在要断的键和新生成的键之间振动的呀...

发出来看看
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6楼2013-01-04 22:34:24
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lei234

新虫 (小有名气)
O-H-1.3-BI-0-2.5-ts.log(1.61MB)
http://kuai.xunlei.com/d/LnU4DdLF45vnUAQA0ac?p=130497
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7楼2013-01-05 11:22:04
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lxhlxh052c

木虫 (著名写手)
★
lei234(金币+2): 谢谢参与
老衲觉得你找到了一个中间体，用IRC跑出来的结构和反应物在QST2吧。
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8楼2013-01-05 13:32:14
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lei234

新虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by lxhlxh052c at 2013-01-05 13:32:14
老衲觉得你找到了一个中间体，用IRC跑出来的结构和反应物在QST2吧。

IRC只得到了产物，还没有得到反应物、、、勒个，用IRC跑出来的结构和反应物在QST2是神马意思？
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9楼2013-01-06 09:18:15
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lxhlxh052c

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
cenwanglai: 金币+3, 谢谢回复 2013-01-06 14:14:52
引用回帖:
9楼: Originally posted by lei234 at 2013-01-06 09:18:15
IRC只得到了产物，还没有得到反应物、、、勒个，用IRC跑出来的结构和反应物在QST2是神马意思？...

你不是用reverse找反应物么？IRC是顺利结束了还是跑几步就死了？
如果你设定100步，在不到100步就正常结束了，那么你得到的结构可能就是一个中间体，用中间体的结构和反应物的结构用QST2方法找这个生成中间体的过渡态。就是说反应物与产物之间有一个中间体，两个过渡态。。
如果是IRC跑死了，是应为IRC的时候最后那点的结构没有收敛造成的，取出该点结构优化，看看能不能得到反应物，要是不能再QST2试试。
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10楼2013-01-06 09:41:14
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小衣冰滢2楼
2013-01-04 10:54   回复  
lei234(金币+2): 谢谢参与
yingying158811楼
2013-01-06 18:16   回复  
lei234(金币+2): 谢谢参与
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