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lei234

新虫 (小有名气)


[交流] IRC

IRC分析用了forward 和reverse ,产物可以得到,可是反应物就是得不到,步长调为25、 15都不行,分子结构基本上没有变,maxcycle=100也没有用肿么办、、、、
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lxhlxh052c

木虫 (著名写手)



lei234(金币+2): 谢谢参与
老衲觉得你找到了一个中间体,用IRC跑出来的结构和反应物在QST2吧。
8楼2013-01-05 13:32:14
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lxhlxh052c

木虫 (著名写手)


★ ★ ★
cenwanglai: 金币+3, 谢谢回复 2013-01-06 14:14:52
引用回帖:
9楼: Originally posted by lei234 at 2013-01-06 09:18:15
IRC只得到了产物,还没有得到反应物、、、勒个,用IRC跑出来的结构和反应物在QST2是神马意思?...

你不是用reverse找反应物么?IRC是顺利结束了还是跑几步就死了?
如果你设定100步,在不到100步就正常结束了,那么你得到的结构可能就是一个中间体,用中间体的结构和反应物的结构用QST2方法找这个生成中间体的过渡态。就是说反应物与产物之间有一个中间体,两个过渡态。。
如果是IRC跑死了,是应为IRC的时候最后那点的结构没有收敛造成的,取出该点结构优化,看看能不能得到反应物,要是不能再QST2试试。
10楼2013-01-06 09:41:14
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