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铜虫 (正式写手)

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[交流] 求教一下下面这个gromacs脚本的含义

求教大神帮解释一下以下脚本每一行的含义，以及如果我想提交一个作业，哪一行需要改动？如何改？还请不吝笔墨，有劳了

#PBS -N gromacs
#PBS -l nodes=1:ppn=12
#PBS -j oe
#PBS -l walltime=1200:00:00

cd $PBS_O_WORKDIR

NP=`cat $PBS_NODEFILE | wc -l`

STARTTIME=`date`
STIME=`date +%s`
echo job started: $STARTTIME
export CURRENT_TIME=`date +"%F"`

source /public1/scripts/intel.sh
source /public1/scripts/openmpi-1.5.4-intel.sh

/public1/soft/gromacs-intel-ompi/bin/grompp -maxwarn 20

/public1/soft/openmpi-1.5.4-intel/bin/mpirun -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NP /public1/soft/gromacs-intel-ompi/bin/mdrun &> gromacs_${PBS_JOBID}.log

echo job finished: `date`
let ETIME=`date +%s`-$STIME
echo Elapsed time: $ETIME

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1楼 2013-01-01 15:25:46

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