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zhongshidaxt金虫 (著名写手)
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[求助]
polyrate2010 安装求助
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各位虫友们： 我做的是有关量子化学计算的课题，需要用到polyrate这个软件。但是安装之后测试不正确，各位大侠能不能帮我指出其中的问题，万分感谢！ 基本信息： polyrate版本： 2010-A OS： linux 安装过程中的相应步骤： [lzzh@HeavyOil polyrate2010rp]$ ./configure Welcome to POLYRATE 2010-A! Do you want POLYRATE 2010-A to be your new default version of POLYRATE? [ yes ]: y Cleaning the src/ directory ... ... processor is x86_64 ... OS is Linux Is this running used to generate Makefile for RP-VTST or VRC-VTST? [ Choose 'RP' or 'VRC' ]: rp which: no ifort in (”/home/lzzh/amber10/bin:/home/lzzh/amber10/bin:/home/lzzh/gaussian/g09:”/bin:/home/lzzh/amber10/bin:/home/lzzh/gaussian/g09:/usr/lib64/qt-3.3/bin:/usr/local/bin:/usr/bin:/bin:/usr/local/sbin:/usr/sbin:/sbin:/home/lzzh/gaussian/g09/g09/bsd:/home/lzzh/gaussian/g09/g09/private:/home/lzzh/gaussian/g09/g09”:/home/lzzh/mpich2/bin:/home/lzzh/bin:/home/lzzh/gaussian/g09/g09/bsd:/home/lzzh/gaussian/g09/g09/private:/home/lzzh/gaussian/g09/g09”:/home/lzzh/mpich2/bin) ....did not find Intel Fortran compiler - ifort ....found GNU Fortran compiler - gfortran :/usr/bin/gfortran ....found MPI compiler :/usr/local/bin/mpif77 which: no icc in (”/home/lzzh/amber10/bin:/home/lzzh/amber10/bin:/home/lzzh/gaussian/g09:”/bin:/home/lzzh/amber10/bin:/home/lzzh/gaussian/g09:/usr/lib64/qt-3.3/bin:/usr/local/bin:/usr/bin:/bin:/usr/local/sbin:/usr/sbin:/sbin:/home/lzzh/gaussian/g09/g09/bsd:/home/lzzh/gaussian/g09/g09/private:/home/lzzh/gaussian/g09/g09”:/home/lzzh/mpich2/bin:/home/lzzh/bin:/home/lzzh/gaussian/g09/g09/bsd:/home/lzzh/gaussian/g09/g09/private:/home/lzzh/gaussian/g09/g09”:/home/lzzh/mpich2/bin) ....did not find Intel C compiler ....found GNU C compiler :/usr/bin/gcc ....found MPI C compiler :/usr/local/bin/mpicc Do the options chosen above look OK? [ yes ]: y ... installing .... creating Makefile ---- POLYRATE INSTALLATION COMPLETE ---- Have a nice day!  .... done with Makefile 显示安装完成，下面是测试过程： [lzzh@HeavyOil ch5]$ ./ch5j1tr1.jc gmake -s ../exe/polyrate2010-A.ch5.serial.exe ivtstm.F:5681.72: pause 'singular matrix in gaussj' 1 警告： 已删除的特性：(1)处的 PAUSE 语句 ivtstm.F:5701.72: if (a(icol,icol).eq.0.) pause 'singular matrix in gaussj' 1 警告： 已删除的特性：(1)处的 PAUSE 语句 main.F:22: Error: Can't open included file 'mpif.h' gmake[1]: *** [main.o] 错误 1 gmake: *** [CH5S] 错误 2 mv: 无法获取"poly.fu1" 的文件状态(stat): 没有那个文件或目录 mv: 无法获取"poly.fu6" 的文件状态(stat): 没有那个文件或目录 mv: 无法获取"poly.fu14" 的文件状态(stat): 没有那个文件或目录 mv: 无法获取"poly.fu15" 的文件状态(stat): 没有那个文件或目录 mv: 无法获取"esp.fu61" 的文件状态(stat): 没有那个文件或目录 结果就出现了上述过程中无法获取相应文件的问题。 RP-VTST or VRC-VTST分别安装，都遇到的同样的问题。自己整理了好久，也没有解决。 各位大侠看是哪一步骤出了问题，期待回复，谢谢！ |
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zhongshidaxt: 金币+10, ★有帮助, 我查出了是缺少intel编译器的问题，但是在linux ubuntu 系统上安装不上intel的编译器，所以到现在还是没能成功安装polyrate 2013-01-08 15:03:52
gmy1990: 金币+2 2013-01-08 16:49:11
zhongshidaxt: 金币+10, ★有帮助, 我查出了是缺少intel编译器的问题，但是在linux ubuntu 系统上安装不上intel的编译器，所以到现在还是没能成功安装polyrate 2013-01-08 15:03:52
gmy1990: 金币+2 2013-01-08 16:49:11
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没有 intel c 和 intel fortran compiler. 你去intel网站上下一个最新版的安装一下。好像有2g大小。文件还是挺大的。 [ 发自手机版 http://muchong.com/3g ] |
2楼2013-01-08 13:55:57
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