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shiyiwenren至尊木虫 (著名写手)
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[求助]
MS模拟单个气体分子在孔道或者界面上的自由能应该用什么模块
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以前一直用MS模拟的时候只是用sorption算算吸附量，吸附热什么的，或者是用forcite模块进行一些简单的结构优化和动力学模拟。最近在模拟一种多级孔道吸附水蒸气分子，但是模拟结果与设想相反，与老板讨论后，给出的建议是分别模拟单个水分子在大孔（也就是介孔）和小孔（微孔）中的自由能，对比两者的大小，就能知道水分子到底是更容易进到介孔还是微孔里了。听说这个计算用Gromacs很容易进行，但是我建好两种单独的孔道模型，向组里用Gromacs模拟的同学帮忙计算的时候，他说需要结构的ITP文件，但是MS不能导出这种文件，向想大家请教一下： （1）MS是否有方法可以导出ITP文件？ （2）MS是否有那个模块实现与gromacs相同的功能 |
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王慧1021
金虫 (小有名气)
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2楼2012-12-20 09:17:37