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lianghust

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] 基因组重测序数据处理

对90G基因组重测序数据进行处理,如果购买服务器,什么样的配置比较好?大约需要多久能处理完
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

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【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
lianghust: 金币+50 2012-12-19 20:08:32
你要说下你准备做什么分析?就算知道,分析时间也很难估计
一般来说,内存要大,如果是BLAST的话,这个特别重要。反正内存也便宜。
服务器关键是稳定,支持热插拔的硬盘比较好,要有RAID。90G的数据真不算大。
2楼2012-12-19 08:00:55
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棉签

银虫 (初入文坛)


【答案】应助回帖

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wizardfan: 金币+2, 谢谢参与 2012-12-25 07:25:40
lianghust: 金币+50, ★★★★★最佳答案 2012-12-25 21:56:53
第一,内存必须要大,像你90GB的数据,我碰到一位客户和你差不多,他要求机器要有1TB的内存做计算。
第二,是CPU,一般来说,预算够可以买四路的服务器。
第三,刚刚楼上也说了,硬盘这方面,如果数据量存储不是很大,买几个SAS的做RAID就行,这样整体机器的速度就快很多。如果有足够预算可以买SSD硬盘做缓存技术。
楼上也说了,服务器的稳定,稳定是服务器必须具备的,主要是那么大的数据量,必须要把机器调优了才能发挥出性能。
3楼2012-12-24 23:20:09
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