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hanxuan8912

新虫 (小有名气)

[交流] 小硕求助,在准备受体文件时加氢加电荷是为什么呢? 已有1人参与

小硕求助,在准备受体文件时加氢加电荷是为什么呢?我应该从哪儿找到这些知识呢?
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因为梦想所以选择远方,因为孤独,所以选择坚强:没有比人更高的山没有比较更长的路,梦想与现实总有接壤的地方!
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lrf1980

新虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-12-20 08:17:54
加氢并且merge no-polar氢是为了计算氢键相互作用
加电荷是为了计算电荷相互作用啊
2楼2012-12-18 12:21:18
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hanxuan8912

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lrf1980 at 2012-12-18 12:21:18
加氢并且merge no-polar氢是为了计算氢键相互作用
加电荷是为了计算电荷相互作用啊

用DOCK加氢的时候,Protonation states for 中有好多选项,这些要怎么考虑呢?

求助1.jpg

因为梦想所以选择远方,因为孤独,所以选择坚强:没有比人更高的山没有比较更长的路,梦想与现实总有接壤的地方!
3楼2012-12-19 23:24:24
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lrf1980

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
没有玩过dock,不过我想你说的protonation state for 好多选项主要是指不同的pH条件下吧,因为不同的氨基酸有不同的等电点。在不同的pH值下,加氢的情况应该是不同的。
4楼2012-12-20 13:35:22
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