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yuanyanf

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[求助] 引物设计

请问下，在设计引物中，设计上游引物和下游引物时都要找模板上的起始密码子和终止密码子吗？模板上那么多的起始密码子和终止密码子应该怎么找呢？上游引物和下游引物在复制的时候会不会自己就配对了啊?我是初学者，希望大家多多指教！

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1楼 2012-12-16 11:02:34

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cicelyzh

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【答案】应助回帖

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感谢参与，应助指数 +1
yuanyanf: 金币+1, ★★★很有帮助 2012-12-16 12:26:52

要看你的引物做什么用。如果是要克隆目的基因出来做表达的话当然是要P完整的基因，引物设计的位置就比较固定。如果是做northern探针或者RT-PCR的话只需要目的基因的一段，不需要从头P到尾的。引物位置的选择自由度较大。设计引物的时候当然要考虑引物的特异性，Tm，引物是否形成稳定二级结构，引物是否形成二聚体等问题。