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lrf1980新虫 (小有名气)
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[交流]
问问大家都用什么工具来生成小分子库的三维构象？ 已有1人参与
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我自己主要用openbabel处理分子库，单个小分子的话用avogadro。 但是我发现openbabel处理的结果跟avogadro的有差异，所以现在没有很合适的软件。大家都用什么啊？ openbabel 我用下面的命令： 先做能量最小化： obminimize －ff Ghemical (or MMFF94) - n 10000 filename 然后选择最优的构象： obconformer 100 500 filename>foldname/filename 另外如果要对两个不同的分子库做合并，合并相同的分子，有什么好办法么？ |
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