应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » tbtrans计算出错，提示nc小于等于零
41/1返回列表
查看: 739  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

maomao-666

木虫 (小有名气)

[求助] tbtrans计算出错，提示nc小于等于零

大家在计算transiesta的时候执行tbtrans的时候出现错误提示
Transport : ERROR : nc <=0
ERROR STOP from Node:    3
[localhost.localdomain:26286] MPI_ABORT invoked on rank 3 in communicator MPI_COMM_WORLD with errorcode 1
Transport : ERROR : nc <=0
ERROR STOP from Node:    0
Transport : ERROR : nc <=0
ERROR STOP from Node:    1
[localhost.localdomain:26284] MPI_ABORT invoked on rank 1 in communicator MPI_COMM_WORLD with errorcode 1
Transport : ERROR : nc <=0
ERROR STOP from Node:    2
[localhost.localdomain:26285] MPI_ABORT invoked on rank 2 in communicator MPI_COMM_WORLD with errorcode 1
[localhost.localdomain:26283] MPI_ABORT invoked on rank 0 in communicator MPI_COMM_WORLD with errorcode 1
请问各位谁遇到过这样的问题，怎么解决的，谢谢了！
下面特出我的散射区输入文件：

SystemName          out
SystemLabel         out

NumberOfAtoms          252
NumberOfSpecies        2
PAO.BasisSize DZ         
PAO.EnergyShift  250 meV
%block ChemicalSpeciesLabel
  1   6  C
  2   8  O
%endblock ChemicalSpeciesLabel

XC.functional GGA
XC.authors    PBE

LatticeConstant     1.000000 Ang
%block LatticeVectors
   20.00000000       0.0000000000        0.0000000000
   0.000000000       20.0000000000        0.0000000000
   0.000000000        0.0000000000       33.810000000
%endblock LatticeVectors

AtomicCoordinatesFormat ScaledCartesian
%block AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies
13.045414579   10.634314983    0.038276168   1   
12.723319542   11.502645961    1.111695271   1   
13.105982751   10.173911103    5.137016908   1   
11.802035455   12.533763358    0.843340495   1   
10.975308027   12.951214743    1.916759598   1   
12.916903266   11.080549315    2.453469150   1   
12.468987748   11.891175979    3.526888253   1   
12.723319542   11.502645961    4.868662133   1   
12.159589235   12.237460251    5.942081236   1   
13.045414579   10.634314983    7.552209891   1   
13.105982751   10.173911103    8.893983770   1   
12.916903266   11.080549315    9.967402874   1   
9.144030826   12.985640126    0.306630943   1   
9.598621059   13.080444962    1.648404823   1   
8.708647919   12.824141023    2.721823926   1   
11.404313569   12.773466379    3.258533478   1   
10.524602102   13.063037848    4.331952581   1   
10.975308027   12.951214743    5.673726460   1   
10.062263822   13.106437748    6.747145563   1   
12.468987748   11.891175979    7.283855115   1   
11.802035455   12.533763358    8.357274218   1   
12.159589235   12.237460251    9.699048098   1   
11.404313569   12.773466379   10.772467201   1   
7.933760700   12.316899760    0.038276168   1   
7.342811533   11.603791787    1.111695271   1   
7.611566089   11.982488532    2.453469150   1   
7.133500564   11.189268983    3.526888253   1   
9.144030826   12.985640126    4.063597805   1   
8.302198070   12.599555276    5.137016908   1   
8.708647919   12.824141023    6.478790788   1   
7.933760700   12.316899760    7.552209891   1   
10.524602102   13.063037848    8.088919443   1   
9.598621059   13.080444962    9.162338546   1   
10.062263822   13.106437748   10.504112425   1   
7.848145270    7.762539749    0.306630943   1   
6.910479716   10.290377665    0.843340495   1   
6.962319926    9.365685017    1.916759598   1   
6.901751754    9.826088897    3.258533478   1   
7.090831239    8.919450685    4.331952581   1   
7.342811533   11.603791787    4.868662133   1   
6.988308844   10.748179875    5.942081236   1   
7.133500564   11.189268983    7.283855115   1   
6.910479716   10.290377665    8.357274218   1   
8.302198070   12.599555276    8.893983770   1   
7.611566089   11.982488532    9.967402874   1   
9.032426479    7.048785257    0.038276168   1   
9.945470683    6.893562252    1.111695271   1   
7.538746757    8.108824021    1.648404823   1   
8.205699050    7.466236642    2.721823926   1   
7.848145270    7.762539749    4.063597805   1   
8.603420936    7.226533621    5.137016908   1   
6.962319926    9.365685017    5.673726460   1   
7.284414963    8.497354039    6.747145563   1   
7.090831239    8.919450685    8.088919443   1   
7.538746757    8.108824021    9.162338546   1   
6.988308844   10.748179875    9.699048098   1   
6.901751754    9.826088897   10.772467201   1   
11.299086587    7.175858977    0.843340495   1   
12.073973805    7.683100240    1.916759598   1   
9.483132403    6.936962152    2.453469150   1   
10.409113446    6.919555038    3.526888253   1   
9.945470683    6.893562252    4.868662133   1   
10.863703679    7.014359874    5.942081236   1   
8.205699050    7.466236642    6.478790788   1   
9.032426479    7.048785257    7.552209891   1   
8.603420936    7.226533621    8.893983770   1   
9.483132403    6.936962152    9.967402874   1   
7.284414963    8.497354039   10.504112425   1   
13.019425661    9.251820125    0.306630943   1   
12.874233941    8.810731017    1.648404823   1   
13.097254789    9.709622335    2.721823926   1   
11.705536435    7.400444724    3.258533478   1   
12.396168416    8.017511468    4.331952581   1   
12.073973805    7.683100240    5.673726460   1   
12.664922972    8.396208213    6.747145563   1   
10.409113446    6.919555038    7.283855115   1   
11.299086587    7.175858977    8.357274218   1   
10.863703679    7.014359874    9.699048098   1   
11.705536435    7.400444724   10.772467201   1   
13.019425661    9.251820125    4.063597805   1   
13.097254789    9.709622335    6.478790788   1   
12.396168416    8.017511468    8.088919443   1   
12.874233941    8.810731017    9.162338546   1   
12.664922972    8.396208213   10.504112425   1   
13.045414579   10.634314983   11.309176753   1   
12.723319542   11.502645961   12.382595856   1   
13.105982751   10.173911103   16.407917494   2   
11.802035455   12.533763358   12.114241080   1   
10.975308027   12.951214743   13.187660184   1   
12.916903266   11.080549315   13.724369735   1   
12.468987748   11.891175979   14.797788839   1   
12.723319542   11.502645961   16.139562718   1   
12.159589235   12.237460251   17.212981821   1   
13.045414579   10.634314983   18.823110476   1   
13.105982751   10.173911103   20.164884355   1   
12.916903266   11.080549315   21.238303459   1   
9.144030826   12.985640126   11.577531529   1   
9.598621059   13.080444962   12.919305408   1   
8.708647919   12.824141023   13.992724511   1   
11.404313569   12.773466379   14.529434063   1   
10.524602102   13.063037848   15.602853166   1   
10.975308027   12.951214743   16.944627045   1   
10.062263822   13.106437748   18.018046149   1   
12.468987748   11.891175979   18.554755700   1   
11.802035455   12.533763358   19.628174804   1   
12.159589235   12.237460251   20.969948683   1   
11.404313569   12.773466379   22.043367786   1   
7.933760700   12.316899760   11.309176753   1   
7.342811533   11.603791787   12.382595856   1   
7.611566089   11.982488532   13.724369735   1   
7.133500564   11.189268983   14.797788839   1   
9.144030826   12.985640126   15.334498390   1   
8.302198070   12.599555276   16.407917494   1   
8.708647919   12.824141023   17.749691373   1   
7.933760700   12.316899760   18.823110476   1   
10.524602102   13.063037848   19.359820028   1   
9.598621059   13.080444962   20.433239131   1   
10.062263822   13.106437748   21.775013010   1   
7.848145270    7.762539749   11.577531529   1   
6.910479716   10.290377665   12.114241080   1   
6.962319926    9.365685017   13.187660184   1   
6.901751754    9.826088897   14.529434063   1   
7.090831239    8.919450685   15.602853166   1   
7.342811533   11.603791787   16.139562718   1   
6.988308844   10.748179875   17.212981821   1   
7.133500564   11.189268983   18.554755700   1   
6.910479716   10.290377665   19.628174804   1   
8.302198070   12.599555276   20.164884355   1   
7.611566089   11.982488532   21.238303459   1   
9.032426479    7.048785257   11.309176753   1   
9.945470683    6.893562252   12.382595856   1   
7.538746757    8.108824021   12.919305408   1   
8.205699050    7.466236642   13.992724511   1   
7.848145270    7.762539749   15.334498390   1   
8.603420936    7.226533621   16.407917494   1   
6.962319926    9.365685017   16.944627045   1   
7.284414963    8.497354039   18.018046149   1   
7.090831239    8.919450685   19.359820028   1   
7.538746757    8.108824021   20.433239131   1   
6.988308844   10.748179875   20.969948683   1   
6.901751754    9.826088897   22.043367786   1   
11.299086587    7.175858977   12.114241080   1   
12.073973805    7.683100240   13.187660184   1   
9.483132403    6.936962152   13.724369735   1   
10.409113446    6.919555038   14.797788839   1   
9.945470683    6.893562252   16.139562718   1   
10.863703679    7.014359874   17.212981821   1   
8.205699050    7.466236642   17.749691373   1   
9.032426479    7.048785257   18.823110476   1   
8.603420936    7.226533621   20.164884355   1   
9.483132403    6.936962152   21.238303459   1   
7.284414963    8.497354039   21.775013010   1   
13.019425661    9.251820125   11.577531529   1   
12.874233941    8.810731017   12.919305408   1   
13.097254789    9.709622335   13.992724511   1   
11.705536435    7.400444724   14.529434063   1   
12.396168416    8.017511468   15.602853166   1   
12.073973805    7.683100240   16.944627045   1   
12.664922972    8.396208213   18.018046149   1   
10.409113446    6.919555038   18.554755700   1   
11.299086587    7.175858977   19.628174804   1   
10.863703679    7.014359874   20.969948683   1   
11.705536435    7.400444724   22.043367786   1   
13.019425661    9.251820125   15.334498390   1   
13.097254789    9.709622335   17.749691373   1   
12.396168416    8.017511468   19.359820028   1   
12.874233941    8.810731017   20.433239131   1   
12.664922972    8.396208213   21.775013010   1   
13.045414579   10.634314983   22.580077338   1   
12.723319542   11.502645961   23.653496441   1   
13.105982751   10.173911103   27.678818079   1   
11.802035455   12.533763358   23.385141665   1   
10.975308027   12.951214743   24.458560769   1   
12.916903266   11.080549315   24.995270320   1   
12.468987748   11.891175979   26.068689424   1   
12.723319542   11.502645961   27.410463303   1   
12.159589235   12.237460251   28.483882406   1   
13.045414579   10.634314983   30.094011061   1   
13.105982751   10.173911103   31.435784940   1   
12.916903266   11.080549315   32.509204044   1   
9.144030826   12.985640126   22.848432114   1   
9.598621059   13.080444962   24.190205993   1   
8.708647919   12.824141023   25.263625096   1   
11.404313569   12.773466379   25.800334648   1   
10.524602102   13.063037848   26.873753751   1   
10.975308027   12.951214743   28.215527630   1   
10.062263822   13.106437748   29.288946734   1   
12.468987748   11.891175979   29.825656285   1   
11.802035455   12.533763358   30.899075389   1   
12.159589235   12.237460251   32.240849268   1   
11.404313569   12.773466379   33.314268371   1   
7.933760700   12.316899760   22.580077338   1   
7.342811533   11.603791787   23.653496441   1   
7.611566089   11.982488532   24.995270320   1   
7.133500564   11.189268983   26.068689424   1   
9.144030826   12.985640126   26.605398975   1   
8.302198070   12.599555276   27.678818079   1   
8.708647919   12.824141023   29.020591958   1   
7.933760700   12.316899760   30.094011061   1   
10.524602102   13.063037848   30.630720613   1   
9.598621059   13.080444962   31.704139716   1   
10.062263822   13.106437748   33.045913595   1   
7.848145270    7.762539749   22.848432114   1   
6.910479716   10.290377665   23.385141665   1   
6.962319926    9.365685017   24.458560769   1   
6.901751754    9.826088897   25.800334648   1   
7.090831239    8.919450685   26.873753751   1   
7.342811533   11.603791787   27.410463303   1   
6.988308844   10.748179875   28.483882406   1   
7.133500564   11.189268983   29.825656285   1   
6.910479716   10.290377665   30.899075389   1   
8.302198070   12.599555276   31.435784940   1   
7.611566089   11.982488532   32.509204044   1   
9.032426479    7.048785257   22.580077338   1   
9.945470683    6.893562252   23.653496441   1   
7.538746757    8.108824021   24.190205993   1   
8.205699050    7.466236642   25.263625096   1   
7.848145270    7.762539749   26.605398975   1   
8.603420936    7.226533621   27.678818079   1   
6.962319926    9.365685017   28.215527630   1   
7.284414963    8.497354039   29.288946734   1   
7.090831239    8.919450685   30.630720613   1   
7.538746757    8.108824021   31.704139716   1   
6.988308844   10.748179875   32.240849268   1   
6.901751754    9.826088897   33.314268371   1   
11.299086587    7.175858977   23.385141665   1   
12.073973805    7.683100240   24.458560769   1   
9.483132403    6.936962152   24.995270320   1   
10.409113446    6.919555038   26.068689424   1   
9.945470683    6.893562252   27.410463303   1   
10.863703679    7.014359874   28.483882406   1   
8.205699050    7.466236642   29.020591958   1   
9.032426479    7.048785257   30.094011061   1   
8.603420936    7.226533621   31.435784940   1   
9.483132403    6.936962152   32.509204044   1   
7.284414963    8.497354039   33.045913595   1   
13.019425661    9.251820125   22.848432114   1   
12.874233941    8.810731017   24.190205993   1   
13.097254789    9.709622335   25.263625096   1   
11.705536435    7.400444724   25.800334648   1   
12.396168416    8.017511468   26.873753751   1   
12.073973805    7.683100240   28.215527630   1   
12.664922972    8.396208213   29.288946734   1   
10.409113446    6.919555038   29.825656285   1   
11.299086587    7.175858977   30.899075389   1   
10.863703679    7.014359874   32.240849268   1   
11.705536435    7.400444724   33.314268371   1   
13.019425661    9.251820125   26.605398975   1   
13.097254789    9.709622335   29.020591958   1   
12.396168416    8.017511468   30.630720613   1   
12.874233941    8.810731017   31.704139716   1   
12.664922972    8.396208213   33.045913595   1   
%endblock AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies
  
%block kgrid_Monkhorst_Pack
   1   0   0  0.0
   0   1   0  0.0
   0   0  10  0.5
%endblock Kgrid_Monkhorst_Pack

MeshCutoff         75.0 Ry

MaxSCFIterations     200
DM.MixingWeight      0.05
DM.NumberPulay       5
DM.Tolerance         1.d-4




SolutionMethod   transiesta                  
# GENGF OPTIONS                              
TS.ComplexContour.Emin        -28 eV         
TS.ComplexContour.NPoles       10            
TS.ComplexContour.NCircle      10            
TS.ComplexContour.NLine        5            
# BIAS OPTIONS                                
TS.biasContour.NumPoints       15            
# TS OPTIONS                                 
TS.Voltage  0  eV                             
                                             
TS.WriteHS  .true.                           
TS.NumUsedAtomsLeft  84                       
TS.NumUsedAtomsRight 84                       
TS.HSFileLeft   '../electrode/electron.TSHS'  
TS.HSFileRight  '../electrode/electron.TSHS'  
TS.TBT.HSFile   './electron.TSHS'            
TS.TBT.Emin    -4.0 eV                        
TS.TBT.Emax     4.0 eV                        
TS.TBT.NPoints   200                          
望高手指教
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-12-15 08:47:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

maomao-666

木虫 (小有名气)
那位高手能解决啊，急求啊。
赞一下 回复此楼
2楼2012-12-15 17:58:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guohuazhong

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★
sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2012-12-27 20:30:36
碰到这种情况，根据我的经验还是先看看编译是不是有问题，建议在编译的时候在arch.make中加上DUMMY_FOX= --enable-dummy
试试，很多情况下，编译器不能正确编译Fox中的东西。
赞一下 回复此楼
3楼2012-12-27 16:07:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

love5264

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by guohuazhong at 2012-12-27 16:07:46
碰到这种情况，根据我的经验还是先看看编译是不是有问题，建议在编译的时候在arch.make中加上DUMMY_FOX= --enable-dummy
试试，很多情况下，编译器不能正确编译Fox中的东西。

请问FOX里的东西做什么的，能具体说说嘛？
赞一下 回复此楼
谋定而动
4楼2013-01-09 20:44:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 maomao-666 的主题更新
41/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿山东大学药学学硕求调剂 +3 开开心心没烦恼 2026-03-23 4/200 2026-03-24 00:06 by 开开心心没烦恼
[考研] 341求调剂(一志愿湖南大学070300) +5 番茄头--- 2026-03-22 6/300 2026-03-23 23:45 by Txy@872106
[考研] 一志愿211 初试270分 求调剂 +4 谷雨上岸 2026-03-23 5/250 2026-03-23 21:18 by 不惑可乐
[考研] 一志愿陕师大生物学071000，298分，求调剂 +3 SYA！ 2026-03-23 3/150 2026-03-23 19:09 by macy2011
[考研] 336化工调剂 +4 王大坦1 2026-03-23 5/250 2026-03-23 18:32 by allen-yin
[考研] 08工学调剂 +7 用户573181 2026-03-20 11/550 2026-03-23 15:47 by 我爱学习学习使�
[考研] 307求调剂 +3 余意卿 2026-03-21 3/150 2026-03-23 10:32 by Iveryant
[考研] 318求调剂 +4 plum李子 2026-03-21 7/350 2026-03-22 14:17 by ColorlessPI
[考研] 化学调剂 +5 yzysaa 2026-03-21 5/250 2026-03-21 22:12 by peike
[考研] 297求调剂 +3 喜欢还是不甘心 2026-03-20 3/150 2026-03-21 18:33 by 学员8dgXkO
[考研] 268求调剂 +9 简单点0 2026-03-17 9/450 2026-03-21 15:37 by lature00
[考研] 303求调剂 +5 睿08 2026-03-17 7/350 2026-03-21 03:11 by JourneyLucky
[考研] 材料工程（专）一志愿985 初试335求调剂 +3 hiloiy 2026-03-17 4/200 2026-03-21 03:04 by JourneyLucky
[考研] 324分 085600材料化工求调剂 +4 llllkkkhh 2026-03-18 4/200 2026-03-21 01:24 by JourneyLucky
[考研] 一志愿华南师大 070300（化学）304分求调剂 +3 0703武芊慧雪304 2026-03-18 3/150 2026-03-21 00:48 by JourneyLucky
[考研] 一志愿 西北大学 ，070300化学学硕，总分287，双非一本，求调剂。 +4 晨昏线与星海 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:15 by JourneyLucky
[考研] 材料学硕297已过四六级求调剂推荐 +11 adaie 2026-03-19 11/550 2026-03-20 21:30 by laoshidan
[考研] 295材料求调剂，一志愿武汉理工085601专硕 +5 Charlieyq 2026-03-19 5/250 2026-03-20 20:35 by JourneyLucky
[考研] 一志愿吉林大学材料学硕321求调剂 +11 Ymlll 2026-03-18 15/750 2026-03-20 19:40 by 丁丁*
[考研] 320求调剂0856 +3 不想起名字112 2026-03-19 3/150 2026-03-19 22:53 by 学员8dgXkO
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭