24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 765  |  回复: 3

maomao-666

木虫 (小有名气)

[求助] tbtrans计算出错,提示nc小于等于零

大家在计算transiesta的时候执行tbtrans的时候出现错误提示
Transport : ERROR : nc <=0
ERROR STOP from Node:    3
[localhost.localdomain:26286] MPI_ABORT invoked on rank 3 in communicator MPI_COMM_WORLD with errorcode 1
Transport : ERROR : nc <=0
ERROR STOP from Node:    0
Transport : ERROR : nc <=0
ERROR STOP from Node:    1
[localhost.localdomain:26284] MPI_ABORT invoked on rank 1 in communicator MPI_COMM_WORLD with errorcode 1
Transport : ERROR : nc <=0
ERROR STOP from Node:    2
[localhost.localdomain:26285] MPI_ABORT invoked on rank 2 in communicator MPI_COMM_WORLD with errorcode 1
[localhost.localdomain:26283] MPI_ABORT invoked on rank 0 in communicator MPI_COMM_WORLD with errorcode 1
请问各位谁遇到过这样的问题,怎么解决的,谢谢了!
下面特出我的散射区输入文件:

SystemName          out
SystemLabel         out

NumberOfAtoms          252
NumberOfSpecies        2
PAO.BasisSize DZ         
PAO.EnergyShift  250 meV
%block ChemicalSpeciesLabel
  1   6  C
  2   8  O
%endblock ChemicalSpeciesLabel

XC.functional GGA
XC.authors    PBE

LatticeConstant     1.000000 Ang
%block LatticeVectors
   20.00000000       0.0000000000        0.0000000000
   0.000000000       20.0000000000        0.0000000000
   0.000000000        0.0000000000       33.810000000
%endblock LatticeVectors

AtomicCoordinatesFormat ScaledCartesian
%block AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies
13.045414579   10.634314983    0.038276168   1   
12.723319542   11.502645961    1.111695271   1   
13.105982751   10.173911103    5.137016908   1   
11.802035455   12.533763358    0.843340495   1   
10.975308027   12.951214743    1.916759598   1   
12.916903266   11.080549315    2.453469150   1   
12.468987748   11.891175979    3.526888253   1   
12.723319542   11.502645961    4.868662133   1   
12.159589235   12.237460251    5.942081236   1   
13.045414579   10.634314983    7.552209891   1   
13.105982751   10.173911103    8.893983770   1   
12.916903266   11.080549315    9.967402874   1   
9.144030826   12.985640126    0.306630943   1   
9.598621059   13.080444962    1.648404823   1   
8.708647919   12.824141023    2.721823926   1   
11.404313569   12.773466379    3.258533478   1   
10.524602102   13.063037848    4.331952581   1   
10.975308027   12.951214743    5.673726460   1   
10.062263822   13.106437748    6.747145563   1   
12.468987748   11.891175979    7.283855115   1   
11.802035455   12.533763358    8.357274218   1   
12.159589235   12.237460251    9.699048098   1   
11.404313569   12.773466379   10.772467201   1   
7.933760700   12.316899760    0.038276168   1   
7.342811533   11.603791787    1.111695271   1   
7.611566089   11.982488532    2.453469150   1   
7.133500564   11.189268983    3.526888253   1   
9.144030826   12.985640126    4.063597805   1   
8.302198070   12.599555276    5.137016908   1   
8.708647919   12.824141023    6.478790788   1   
7.933760700   12.316899760    7.552209891   1   
10.524602102   13.063037848    8.088919443   1   
9.598621059   13.080444962    9.162338546   1   
10.062263822   13.106437748   10.504112425   1   
7.848145270    7.762539749    0.306630943   1   
6.910479716   10.290377665    0.843340495   1   
6.962319926    9.365685017    1.916759598   1   
6.901751754    9.826088897    3.258533478   1   
7.090831239    8.919450685    4.331952581   1   
7.342811533   11.603791787    4.868662133   1   
6.988308844   10.748179875    5.942081236   1   
7.133500564   11.189268983    7.283855115   1   
6.910479716   10.290377665    8.357274218   1   
8.302198070   12.599555276    8.893983770   1   
7.611566089   11.982488532    9.967402874   1   
9.032426479    7.048785257    0.038276168   1   
9.945470683    6.893562252    1.111695271   1   
7.538746757    8.108824021    1.648404823   1   
8.205699050    7.466236642    2.721823926   1   
7.848145270    7.762539749    4.063597805   1   
8.603420936    7.226533621    5.137016908   1   
6.962319926    9.365685017    5.673726460   1   
7.284414963    8.497354039    6.747145563   1   
7.090831239    8.919450685    8.088919443   1   
7.538746757    8.108824021    9.162338546   1   
6.988308844   10.748179875    9.699048098   1   
6.901751754    9.826088897   10.772467201   1   
11.299086587    7.175858977    0.843340495   1   
12.073973805    7.683100240    1.916759598   1   
9.483132403    6.936962152    2.453469150   1   
10.409113446    6.919555038    3.526888253   1   
9.945470683    6.893562252    4.868662133   1   
10.863703679    7.014359874    5.942081236   1   
8.205699050    7.466236642    6.478790788   1   
9.032426479    7.048785257    7.552209891   1   
8.603420936    7.226533621    8.893983770   1   
9.483132403    6.936962152    9.967402874   1   
7.284414963    8.497354039   10.504112425   1   
13.019425661    9.251820125    0.306630943   1   
12.874233941    8.810731017    1.648404823   1   
13.097254789    9.709622335    2.721823926   1   
11.705536435    7.400444724    3.258533478   1   
12.396168416    8.017511468    4.331952581   1   
12.073973805    7.683100240    5.673726460   1   
12.664922972    8.396208213    6.747145563   1   
10.409113446    6.919555038    7.283855115   1   
11.299086587    7.175858977    8.357274218   1   
10.863703679    7.014359874    9.699048098   1   
11.705536435    7.400444724   10.772467201   1   
13.019425661    9.251820125    4.063597805   1   
13.097254789    9.709622335    6.478790788   1   
12.396168416    8.017511468    8.088919443   1   
12.874233941    8.810731017    9.162338546   1   
12.664922972    8.396208213   10.504112425   1   
13.045414579   10.634314983   11.309176753   1   
12.723319542   11.502645961   12.382595856   1   
13.105982751   10.173911103   16.407917494   2   
11.802035455   12.533763358   12.114241080   1   
10.975308027   12.951214743   13.187660184   1   
12.916903266   11.080549315   13.724369735   1   
12.468987748   11.891175979   14.797788839   1   
12.723319542   11.502645961   16.139562718   1   
12.159589235   12.237460251   17.212981821   1   
13.045414579   10.634314983   18.823110476   1   
13.105982751   10.173911103   20.164884355   1   
12.916903266   11.080549315   21.238303459   1   
9.144030826   12.985640126   11.577531529   1   
9.598621059   13.080444962   12.919305408   1   
8.708647919   12.824141023   13.992724511   1   
11.404313569   12.773466379   14.529434063   1   
10.524602102   13.063037848   15.602853166   1   
10.975308027   12.951214743   16.944627045   1   
10.062263822   13.106437748   18.018046149   1   
12.468987748   11.891175979   18.554755700   1   
11.802035455   12.533763358   19.628174804   1   
12.159589235   12.237460251   20.969948683   1   
11.404313569   12.773466379   22.043367786   1   
7.933760700   12.316899760   11.309176753   1   
7.342811533   11.603791787   12.382595856   1   
7.611566089   11.982488532   13.724369735   1   
7.133500564   11.189268983   14.797788839   1   
9.144030826   12.985640126   15.334498390   1   
8.302198070   12.599555276   16.407917494   1   
8.708647919   12.824141023   17.749691373   1   
7.933760700   12.316899760   18.823110476   1   
10.524602102   13.063037848   19.359820028   1   
9.598621059   13.080444962   20.433239131   1   
10.062263822   13.106437748   21.775013010   1   
7.848145270    7.762539749   11.577531529   1   
6.910479716   10.290377665   12.114241080   1   
6.962319926    9.365685017   13.187660184   1   
6.901751754    9.826088897   14.529434063   1   
7.090831239    8.919450685   15.602853166   1   
7.342811533   11.603791787   16.139562718   1   
6.988308844   10.748179875   17.212981821   1   
7.133500564   11.189268983   18.554755700   1   
6.910479716   10.290377665   19.628174804   1   
8.302198070   12.599555276   20.164884355   1   
7.611566089   11.982488532   21.238303459   1   
9.032426479    7.048785257   11.309176753   1   
9.945470683    6.893562252   12.382595856   1   
7.538746757    8.108824021   12.919305408   1   
8.205699050    7.466236642   13.992724511   1   
7.848145270    7.762539749   15.334498390   1   
8.603420936    7.226533621   16.407917494   1   
6.962319926    9.365685017   16.944627045   1   
7.284414963    8.497354039   18.018046149   1   
7.090831239    8.919450685   19.359820028   1   
7.538746757    8.108824021   20.433239131   1   
6.988308844   10.748179875   20.969948683   1   
6.901751754    9.826088897   22.043367786   1   
11.299086587    7.175858977   12.114241080   1   
12.073973805    7.683100240   13.187660184   1   
9.483132403    6.936962152   13.724369735   1   
10.409113446    6.919555038   14.797788839   1   
9.945470683    6.893562252   16.139562718   1   
10.863703679    7.014359874   17.212981821   1   
8.205699050    7.466236642   17.749691373   1   
9.032426479    7.048785257   18.823110476   1   
8.603420936    7.226533621   20.164884355   1   
9.483132403    6.936962152   21.238303459   1   
7.284414963    8.497354039   21.775013010   1   
13.019425661    9.251820125   11.577531529   1   
12.874233941    8.810731017   12.919305408   1   
13.097254789    9.709622335   13.992724511   1   
11.705536435    7.400444724   14.529434063   1   
12.396168416    8.017511468   15.602853166   1   
12.073973805    7.683100240   16.944627045   1   
12.664922972    8.396208213   18.018046149   1   
10.409113446    6.919555038   18.554755700   1   
11.299086587    7.175858977   19.628174804   1   
10.863703679    7.014359874   20.969948683   1   
11.705536435    7.400444724   22.043367786   1   
13.019425661    9.251820125   15.334498390   1   
13.097254789    9.709622335   17.749691373   1   
12.396168416    8.017511468   19.359820028   1   
12.874233941    8.810731017   20.433239131   1   
12.664922972    8.396208213   21.775013010   1   
13.045414579   10.634314983   22.580077338   1   
12.723319542   11.502645961   23.653496441   1   
13.105982751   10.173911103   27.678818079   1   
11.802035455   12.533763358   23.385141665   1   
10.975308027   12.951214743   24.458560769   1   
12.916903266   11.080549315   24.995270320   1   
12.468987748   11.891175979   26.068689424   1   
12.723319542   11.502645961   27.410463303   1   
12.159589235   12.237460251   28.483882406   1   
13.045414579   10.634314983   30.094011061   1   
13.105982751   10.173911103   31.435784940   1   
12.916903266   11.080549315   32.509204044   1   
9.144030826   12.985640126   22.848432114   1   
9.598621059   13.080444962   24.190205993   1   
8.708647919   12.824141023   25.263625096   1   
11.404313569   12.773466379   25.800334648   1   
10.524602102   13.063037848   26.873753751   1   
10.975308027   12.951214743   28.215527630   1   
10.062263822   13.106437748   29.288946734   1   
12.468987748   11.891175979   29.825656285   1   
11.802035455   12.533763358   30.899075389   1   
12.159589235   12.237460251   32.240849268   1   
11.404313569   12.773466379   33.314268371   1   
7.933760700   12.316899760   22.580077338   1   
7.342811533   11.603791787   23.653496441   1   
7.611566089   11.982488532   24.995270320   1   
7.133500564   11.189268983   26.068689424   1   
9.144030826   12.985640126   26.605398975   1   
8.302198070   12.599555276   27.678818079   1   
8.708647919   12.824141023   29.020591958   1   
7.933760700   12.316899760   30.094011061   1   
10.524602102   13.063037848   30.630720613   1   
9.598621059   13.080444962   31.704139716   1   
10.062263822   13.106437748   33.045913595   1   
7.848145270    7.762539749   22.848432114   1   
6.910479716   10.290377665   23.385141665   1   
6.962319926    9.365685017   24.458560769   1   
6.901751754    9.826088897   25.800334648   1   
7.090831239    8.919450685   26.873753751   1   
7.342811533   11.603791787   27.410463303   1   
6.988308844   10.748179875   28.483882406   1   
7.133500564   11.189268983   29.825656285   1   
6.910479716   10.290377665   30.899075389   1   
8.302198070   12.599555276   31.435784940   1   
7.611566089   11.982488532   32.509204044   1   
9.032426479    7.048785257   22.580077338   1   
9.945470683    6.893562252   23.653496441   1   
7.538746757    8.108824021   24.190205993   1   
8.205699050    7.466236642   25.263625096   1   
7.848145270    7.762539749   26.605398975   1   
8.603420936    7.226533621   27.678818079   1   
6.962319926    9.365685017   28.215527630   1   
7.284414963    8.497354039   29.288946734   1   
7.090831239    8.919450685   30.630720613   1   
7.538746757    8.108824021   31.704139716   1   
6.988308844   10.748179875   32.240849268   1   
6.901751754    9.826088897   33.314268371   1   
11.299086587    7.175858977   23.385141665   1   
12.073973805    7.683100240   24.458560769   1   
9.483132403    6.936962152   24.995270320   1   
10.409113446    6.919555038   26.068689424   1   
9.945470683    6.893562252   27.410463303   1   
10.863703679    7.014359874   28.483882406   1   
8.205699050    7.466236642   29.020591958   1   
9.032426479    7.048785257   30.094011061   1   
8.603420936    7.226533621   31.435784940   1   
9.483132403    6.936962152   32.509204044   1   
7.284414963    8.497354039   33.045913595   1   
13.019425661    9.251820125   22.848432114   1   
12.874233941    8.810731017   24.190205993   1   
13.097254789    9.709622335   25.263625096   1   
11.705536435    7.400444724   25.800334648   1   
12.396168416    8.017511468   26.873753751   1   
12.073973805    7.683100240   28.215527630   1   
12.664922972    8.396208213   29.288946734   1   
10.409113446    6.919555038   29.825656285   1   
11.299086587    7.175858977   30.899075389   1   
10.863703679    7.014359874   32.240849268   1   
11.705536435    7.400444724   33.314268371   1   
13.019425661    9.251820125   26.605398975   1   
13.097254789    9.709622335   29.020591958   1   
12.396168416    8.017511468   30.630720613   1   
12.874233941    8.810731017   31.704139716   1   
12.664922972    8.396208213   33.045913595   1   
%endblock AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies
  
%block kgrid_Monkhorst_Pack
   1   0   0  0.0
   0   1   0  0.0
   0   0  10  0.5
%endblock Kgrid_Monkhorst_Pack

MeshCutoff         75.0 Ry

MaxSCFIterations     200
DM.MixingWeight      0.05
DM.NumberPulay       5
DM.Tolerance         1.d-4




SolutionMethod   transiesta                  
# GENGF OPTIONS                              
TS.ComplexContour.Emin        -28 eV         
TS.ComplexContour.NPoles       10            
TS.ComplexContour.NCircle      10            
TS.ComplexContour.NLine        5            
# BIAS OPTIONS                                
TS.biasContour.NumPoints       15            
# TS OPTIONS                                 
TS.Voltage  0  eV                             
                                             
TS.WriteHS  .true.                           
TS.NumUsedAtomsLeft  84                       
TS.NumUsedAtomsRight 84                       
TS.HSFileLeft   '../electrode/electron.TSHS'  
TS.HSFileRight  '../electrode/electron.TSHS'  
TS.TBT.HSFile   './electron.TSHS'            
TS.TBT.Emin    -4.0 eV                        
TS.TBT.Emax     4.0 eV                        
TS.TBT.NPoints   200                          
望高手指教
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

maomao-666

木虫 (小有名气)

那位高手能解决啊,急求啊。
2楼2012-12-15 17:58:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guohuazhong

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2012-12-27 20:30:36
碰到这种情况,根据我的经验还是先看看编译是不是有问题,建议在编译的时候在arch.make中加上DUMMY_FOX= --enable-dummy
试试,很多情况下,编译器不能正确编译Fox中的东西。
3楼2012-12-27 16:07:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

love5264

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by guohuazhong at 2012-12-27 16:07:46
碰到这种情况,根据我的经验还是先看看编译是不是有问题,建议在编译的时候在arch.make中加上DUMMY_FOX= --enable-dummy
试试,很多情况下,编译器不能正确编译Fox中的东西。

请问FOX里的东西做什么的,能具体说说嘛?
谋定而动
4楼2013-01-09 20:44:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 maomao-666 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 272分材料子求调剂 +40 Loy0361 2026-04-10 52/2600 2026-04-12 19:23 by laoshidan
[考研] 313求调剂 +5 余摆摆是大哥 2026-04-11 5/250 2026-04-12 10:34 by 猪会飞
[考研] 305求调剂 +7 玛卡巴卡boom 2026-04-11 7/350 2026-04-12 07:35 by zhouxiaoyu
[考研] 调剂 +5 文道星台 2026-04-11 5/250 2026-04-11 15:01 by 凯凯要变帅
[考研] 本人女孩 +7 吼吼, 2026-04-10 9/450 2026-04-11 14:45 by ACS Nano——
[考研] 085410 273分调剂 +4 X1999 2026-04-09 4/200 2026-04-11 13:05 by pies112
[考研] 085600材料与化工329分求调剂 +16 叶zilin 2026-04-10 16/800 2026-04-11 11:04 by may_新宇
[考研] 材料与化工调剂 +12 否极泰来2026 2026-04-10 13/650 2026-04-11 00:28 by wangjihu
[考研] 化学工程与技术324调剂 +23 孙常华 2026-04-09 25/1250 2026-04-11 00:07 by 骑牛渡寒江
[考研] 22408 366分,本科211,一志愿西工大 +4 Rubt 2026-04-09 4/200 2026-04-10 19:51 by chemisry
[考研] 071000生物学调剂求助 +17 zzzzwww 2026-04-09 20/1000 2026-04-10 15:55 by 求调剂zz
[考研] 085601初试330分找调剂 +10 流心奶黄包l 2026-04-09 10/500 2026-04-10 08:14 by Sammy2
[考研] 材料专硕初试分332一志愿西北工业大学, +12 故人?? 2026-04-09 12/600 2026-04-09 18:34 by Ccclqqq
[论文投稿] 求助文献原文 10+3 18500821399 2026-04-08 3/150 2026-04-09 16:56 by 北京莱茵润色
[考研] 086004 求调剂 309 +7 Yin DY 2026-04-08 7/350 2026-04-09 13:59 by Delta2012
[考研] 一志愿华东理工085601材料工程303分求调剂 +15 a1708 2026-04-06 15/750 2026-04-08 16:23 by luoyongfeng
[考研] 304求调剂 +10 素年祭语 2026-04-06 17/850 2026-04-08 09:05 by 蓝云思雨
[考研] 388求调剂 +6 四川王涛 2026-04-07 8/400 2026-04-08 00:17 by JourneyLucky
[考研] 333求调剂 +6 合乘杨习夕 2026-04-06 6/300 2026-04-07 09:44 by 猪会飞
[考研] 285求调剂 +5 mapmath 2026-04-06 6/300 2026-04-06 17:18 by 蓝云思雨
信息提示
请填处理意见