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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 在碳纳米管上加-COOH或-OH 或-NH2
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xingyanfei

金虫 (正式写手)

[求助] 在碳纳米管上加-COOH或-OH 或-NH2

有没有方法用VMD将SWNT 上加-COOH 或-OH这样小的集团，
我试了试用MS 将-COOH与SWNT上C原子相结，但是生成pdb 文件导入VMD中就不是原来的样子了，并且还无法自动生成psf 文件，
有没有好的方法的呢？
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1楼 2012-12-13 21:27:46
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xingyanfei

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-12-14 23:04:08
以后我的回复，不要给我金币了。呵呵，我现在金币够用...

哎呀，没人回复，只能给你了，凑合着拿着吧！！
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5楼2012-12-17 12:12:39
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+3, 谢谢 2012-12-14 15:55:44
xingyanfei: 金币+4, ★★★很有帮助 2012-12-14 21:06:57
当然有办法了，VMD的这个功能：去看看官网的教程
恕我多嘴，这个不好用，还不如MS
不能自动生成PSF,你可以手动操作啊

[ Last edited by jiaoyixiong on 2012-12-14 at 15:17 ]
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2楼2012-12-14 15:16:40
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)
引用回帖:
3楼: Originally posted by xingyanfei at 2012-12-14 21:07:11
谢谢了！！~

以后我的回复，不要给我金币了。呵呵，我现在金币够用
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4楼2012-12-14 23:04:08
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