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xufund

至尊木虫 (知名作家)

[求助] iGemDock的结果可以用什么软件画出高质量的图谱

坛子里的兄弟有没有用过iGemDock?它自带的Rasmol给出的图效果太差。请问用什么软件可以绘制高质量的(能发文章)对接结果图?
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
xufund: 金币+2, 有帮助, 谢谢应助 2012-12-13 06:40:31
zh1987hs: 金币+2, 貌似要显示对接的结果~还是pymol来的漂亮一些~哈哈 2012-12-13 09:11:58
不懂iGemDock ,
不知道楼主是不是分子模拟的结果,要处理显示分子轨迹,结果等,要是这样的话,可以使用VMD,VMD是非常强大的分子显示软件,可以显示输出高清图片。

要是楼上输出数据图的高清结果,把数据处理好后使用origin即可。
2楼2012-12-12 21:28:51
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xufund

至尊木虫 (知名作家)

是小分子与蛋白的对接结果。要处理显示氢键、疏水相互作用和静电作用等
3楼2012-12-13 06:42:21
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caixin5120

木虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-12-16 09:45:00
xufund: 金币+2, ★★★很有帮助, 谢谢帮助 2012-12-17 20:49:48
呵呵 最好,最漂亮的还是pymol作图。疏水相互作用 可能需要使用chimera,http://www.bioms.org/thread-8-1-1.html  这个帖子或许对你有帮助。
4楼2012-12-15 23:59:50
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xufund

至尊木虫 (知名作家)

引用回帖:
4楼: Originally posted by caixin5120 at 2012-12-15 23:59:50
呵呵 最好,最漂亮的还是pymol作图。疏水相互作用 可能需要使用chimera,http://www.bioms.org/thread-8-1-1.html  这个帖子或许对你有帮助。

你给的链接不能下载,能否转载在这里供下载?多谢
5楼2012-12-17 20:50:38
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caixin5120

木虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

★ ★
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-12-18 11:09:58
我给你的是一个pymol使用教程贴,软件可以从其他地方下载吧:)百度 google一下
6楼2012-12-18 10:29:57
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