24小时热门版块排行榜    

查看: 1241  |  回复: 5

xufund

至尊木虫 (知名作家)

[求助] iGemDock的结果可以用什么软件画出高质量的图谱

坛子里的兄弟有没有用过iGemDock?它自带的Rasmol给出的图效果太差。请问用什么软件可以绘制高质量的(能发文章)对接结果图?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
xufund: 金币+2, 有帮助, 谢谢应助 2012-12-13 06:40:31
zh1987hs: 金币+2, 貌似要显示对接的结果~还是pymol来的漂亮一些~哈哈 2012-12-13 09:11:58
不懂iGemDock ,
不知道楼主是不是分子模拟的结果,要处理显示分子轨迹,结果等,要是这样的话,可以使用VMD,VMD是非常强大的分子显示软件,可以显示输出高清图片。

要是楼上输出数据图的高清结果,把数据处理好后使用origin即可。
2楼2012-12-12 21:28:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xufund

至尊木虫 (知名作家)

是小分子与蛋白的对接结果。要处理显示氢键、疏水相互作用和静电作用等
3楼2012-12-13 06:42:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

caixin5120

木虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-12-16 09:45:00
xufund: 金币+2, ★★★很有帮助, 谢谢帮助 2012-12-17 20:49:48
呵呵 最好,最漂亮的还是pymol作图。疏水相互作用 可能需要使用chimera,http://www.bioms.org/thread-8-1-1.html  这个帖子或许对你有帮助。
4楼2012-12-15 23:59:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xufund

至尊木虫 (知名作家)

引用回帖:
4楼: Originally posted by caixin5120 at 2012-12-15 23:59:50
呵呵 最好,最漂亮的还是pymol作图。疏水相互作用 可能需要使用chimera,http://www.bioms.org/thread-8-1-1.html  这个帖子或许对你有帮助。

你给的链接不能下载,能否转载在这里供下载?多谢
5楼2012-12-17 20:50:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

caixin5120

木虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

★ ★
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-12-18 11:09:58
我给你的是一个pymol使用教程贴,软件可以从其他地方下载吧:)百度 google一下
6楼2012-12-18 10:29:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xufund 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求老师收留调剂 +4 jiang姜66 2026-03-14 5/250 2026-03-15 20:11 by Winj1e
[考研] 294求调剂 +3 Zys010410@ 2026-03-13 4/200 2026-03-15 10:59 by zhq0425
[考研] 080500,材料学硕302分求调剂学校 +4 初识可乐 2026-03-14 5/250 2026-03-14 21:08 by peike
[考研] 中科大材料与化工319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:10 by ms629
[考研] 材料080500调剂求收留 +3 一颗meteor 2026-03-13 3/150 2026-03-14 10:54 by peike
[考研] 0856材料与化工309分求调剂 +6 ZyZy…… 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:38 by JourneyLucky
[考研] 一志愿中科院,化学方向,295求调剂 +4 一氧二氮 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:35 by JourneyLucky
[考研] 26调剂/材料/英一数二/总分289/已过A区线 +6 步川酷紫123 2026-03-13 6/300 2026-03-13 21:59 by 星空星月
[考研] 333求调剂 +3 球球古力 2026-03-11 3/150 2026-03-13 21:27 by JourneyLucky
[考研] (081700)化学工程与技术-298分求调剂 +12 11啦啦啦 2026-03-11 35/1750 2026-03-13 21:25 by JourneyLucky
[考研] 315求调剂 +9 小羊小羊_ 2026-03-11 10/500 2026-03-13 21:13 by SXNU李老师
[考研] 311求调剂 +3 冬十三 2026-03-13 3/150 2026-03-13 20:41 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +7 18880831720 2026-03-11 7/350 2026-03-13 16:10 by JourneyLucky
[考研] 295求调剂 +3 小匕仔汁 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:17 by vgtyfty
[考研] 290求调剂 +7 ADT 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:17 by JourneyLucky
[考研] 085600材料与化工 309分请求调剂 +7 dtdxzxx 2026-03-12 8/400 2026-03-13 14:43 by jxchenghu
[论文投稿] 投稿问题 5+4 星光灿烂xt 2026-03-12 6/300 2026-03-13 14:17 by god_tian
[考博] 26读博 +4 Rui135246 2026-03-12 10/500 2026-03-13 07:15 by gaobiao
[考研] 一志愿:武汉理工,材料工程,英二数二 总分314 +3 2202020125 2026-03-10 4/200 2026-03-10 13:54 by xiongyaxuan
[硕博家园] 木虫好像不热闹了,是不是? +4 偏振片 2026-03-10 4/200 2026-03-10 09:51 by longwave
信息提示
请填处理意见