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铁甲威虫

银虫 (正式写手)

[求助] 如何在gaussian view03中画一中虚线的键???

小弟在计算某氢键的作用,其中H原子与X原子是用虚线那种键连接的,是在GV05下画的,最后在Gaussian 03中计算,结果出错了!我怀疑是GV05制作的GJF文件与Gaussian 03不兼容,请问在GV03中如何画那种虚线的键呢?麻烦各位大侠指教指教。

[ Last edited by 铁甲威虫 on 2012-12-10 at 13:34 ]
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luosizuo

禁虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
铁甲威虫: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-12-12 12:32:13
本帖内容被屏蔽

2楼2012-12-10 13:53:38
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
铁甲威虫: 金币+10, ★★★很有帮助 2012-12-12 12:32:26
应是GV05制作的GJF文件与Gaussian 03不兼容。程序一般是向下兼容。
GV3制作的GJF文件,只有原子坐标,这决定原子之间的距离,不会包含那种虚线的键这样的约定。
3楼2012-12-10 14:28:01
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铁甲威虫

银虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by zhou2009 at 2012-12-10 14:28:01
应是GV05制作的GJF文件与Gaussian 03不兼容。程序一般是向下兼容。
GV3制作的GJF文件,只有原子坐标,这决定原子之间的距离,不会包含那种虚线的键这样的约定。

如果我想弄成氢键的话,那在GV03中应该用什么来在表示氢键呢???
4楼2012-12-10 14:50:08
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wangsihang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
铁甲威虫: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-12-12 12:33:10
氢键的表示是需要根据键长来的,你要查查相关的文献或手册,看看H-X键之间如果形成氢键,键长为多少,如果直接用高斯算的话,得出的应该是最稳定的结构。
5楼2012-12-10 15:03:36
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铁甲威虫

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by luosizuo at 2012-12-10 13:53:38
计算应该是兼容的,计算出错是键的问题吗?

我计算了两个不同的东西 我贴出哪两个的LOG文件的最后语句给你看看,谢谢你大侠

1. MaxMem=  262144000 cpu:   0.1
Error parsing command line argument 7 string "1.rwf,268435456,/hom" as integer.
Error termination via Lnk1e at Mon Dec 10 11:20:38 2012.


2. Big=F Error parsing command line argument 7 string    "1.rwf,268435456,/hom" as integer.
Error termination via Lnk1e at Mon Dec 10 11:03:01 2012.
6楼2012-12-10 20:27:47
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铁甲威虫

银虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by zhou2009 at 2012-12-10 14:28:01
应是GV05制作的GJF文件与Gaussian 03不兼容。程序一般是向下兼容。
GV3制作的GJF文件,只有原子坐标,这决定原子之间的距离,不会包含那种虚线的键这样的约定。

我计算了两个不同的东西 我贴出哪两个的LOG文件的最后语句给你看看,谢谢你大侠

1. MaxMem=  262144000 cpu:   0.1
Error parsing command line argument 7 string "1.rwf,268435456,/hom" as integer.
Error termination via Lnk1e at Mon Dec 10 11:20:38 2012.


2. Big=F Error parsing command line argument 7 string    "1.rwf,268435456,/hom" as integer.
Error termination via Lnk1e at Mon Dec 10 11:03:01 2012.
7楼2012-12-10 20:28:18
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铁甲威虫

银虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by wangsihang at 2012-12-10 15:03:36
氢键的表示是需要根据键长来的,你要查查相关的文献或手册,看看H-X键之间如果形成氢键,键长为多少,如果直接用高斯算的话,得出的应该是最稳定的结构。

我计算了两个不同的东西 我贴出哪两个的LOG文件的最后语句给你看看,谢谢你大侠

1. MaxMem=  262144000 cpu:   0.1
Error parsing command line argument 7 string "1.rwf,268435456,/hom" as integer.
Error termination via Lnk1e at Mon Dec 10 11:20:38 2012.


2. Big=F Error parsing command line argument 7 string    "1.rwf,268435456,/hom" as integer.
Error termination via Lnk1e at Mon Dec 10 11:03:01 2012.
8楼2012-12-10 20:28:25
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luosizuo

禁虫 (小有名气)

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9楼2012-12-10 21:27:54
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