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wuy069铁杆木虫 (正式写手)
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[求助]
请教：用Shell, awk, perl等语言实现监视SGE集群节点和任务
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请教：用Shell, awk, perl等语言实现监视SGE集群节点和任务 简单的bash shell和awk语言会点，但弄个复杂的脚本，功底还是不够 下面的格式有点错位，我把相应的内容以附件粘贴了。 [wuy@cluster test]$ qhost -j HOSTNAME ARCH NCPU LOAD MEMTOT MEMUSE SWAPTO SWAPUS ------------------------------------------------------------------------------- global - - - - - - - compute-0-0 lx26-amd64 4 2.97 3.9G 3.5G 4.0G 2.9G job-ID prior name user state submit/start at queue master ja-task-ID ---------------------------------------------------------------------------------------------- 6 0.50500 test1.sh wuy r 12/09/2012 14:47:26 all.q@comp MASTER 7 0.60500 test4.sh wuy r 12/09/2012 14:47:26 all.q@comp MASTER all.q@comp SLAVE all.q@comp SLAVE compute-0-1 lx26-amd64 4 3.56 3.9G 3.8G 4.0G 3.1G job-ID prior name user state submit/start at queue master ja-task-ID ---------------------------------------------------------------------------------------------- 8 0.60500 test2.sh tester r 12/09/2012 14:48:52 all.q@comp MASTER all.q@comp SLAVE all.q@comp SLAVE 9 0.60500 test3.sh tester r 12/09/2012 14:48:52 all.q@comp MASTER all.q@comp SLAVE all.q@comp SLAVE 在compute-0-0节点上有两个任务6和7，所用的cpu分别为1和2；在compute-0-1节点上有两个任务8和9，所用的cpu分别为2和2. 使用Shell, awk, perl等语言获得的命令脚本打印输出下面所示： ------------------------------------------------------------------------------------------------ node state load ncpu mem memuse swapto swapus tasks jobids/users ------------------------------------------------------------------------------------------------ compute-0-0 free 2.97 4 3.9G 3.5G 4.0G 2.9G 3 6/wuy 7/wuy compute-0-1 busy 3.56 4 3.9G 3.8G 4.0G 3.1G 4 8/tester 9/tester 其中，当node的LOAD为“-”时，相应node的state为down. 下面是根据qstat命令编写脚本监视任务的申请时间和逝去时间 [wuy@cluster test]$ qstat -u '*' job-ID prior name user state submit/start at queue slots ja-task-ID ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 6 0.50500 test1.sh wuy r 12/09/2012 14:47:26 all.q@compute-0-0.local 1 7 0.60500 test4.sh wuy r 12/09/2012 14:47:26 all.q@compute-0-0.local 2 8 0.60500 test2.sh tester r 12/09/2012 14:48:52 all.q@compute-0-1.local 2 9 0.60500 test3.sh tester r 12/09/2012 14:48:52 all.q@compute-0-1.local 2 [wuy@cluster test]$ qstat -j 6 |grep h_rt hard resource_list: h_rt=3600 得到的申请时间（reqtime）为3600s，改为小时制：1:00:00 逝去的时间（elaptime)为现在的时间`date`减去任务开始的时间 使用Shell, awk, perl等语言获得的命令脚本打印输出下面所示 job-ID name user state submit/start at queue slots reqtime elaptime -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 6 test1.sh wuy r 12/09/2012 14:47:26 all.q@compute-0-0.local 1 1:00:00 00:50:00 7 test4.sh wuy r 12/09/2012 14:47:26 all.q@compute-0-0.local 2 2:00:00 00:50:00 8 test2.sh tester r 12/09/2012 14:48:52 all.q@compute-0-1.local 2 5:00:00 00:48:34 9 test3.sh tester r 12/09/2012 14:48:52 all.q@compute-0-1.local 2 12:00:00 00:48:34[ Last edited by wuy069 on 2012-12-9 at 18:30 ] |
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2012-12-09 18:30:44, 4.22 K
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wuy069
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谢谢！从网上能看到一些： 颜色："\033[1;5;37;41mdown\033[0m" flag: # Flag nodes with status down, offline or unknown if (state[node] == "busy" || state[node] == "down" || state[node] == "offl" || state[node] == "UNKN"  {stateflag="*" listnode++ } else stateflag=" " # Flag unexpected CPU load average loaddiff = loadave[node] - numtasks[node] if (loaddiff > 0.5 || loaddiff < -0.5) { loadflag="*" listnode++ } else loadflag=" " # Resident memory resi = (totmem[node]-availmem[node])/1024 if (resi > 50 && resi > physmem[node]/1024 - 50) { # High memory usage resiflag="*" listnode++ } else resiflag=" " # Flag unexpected number of processes or users if (nsessions[node] > 2*ncpus[node] + 1) { # More than 2 sessions per job sessflag="*" listnode++ } else if (nusers[node] > ncpus[node]) { # More users than nCPUs is bad sessflag="*" listnode++ } else sessflag=" " # Flag unexpected number of jobs if (numjobs[node] > numtasks[node]) { # Should be at least 1 task per job jobflag="*" listnode++ } else jobflag=" " 组合在一起不会，抽时间看看教程； 谢谢！ |
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嗯，shell+awk应该是能实现的，awk学的不咋好，一时半会整不出来 根据qhost -j命令输出的结果，编写一个脚本打印出： ------------------------------------------------------------------------------------------------ node state load ncpu mem memuse swapto swapus tasks jobids/users ------------------------------------------------------------------------------------------------ compute-0-0 free 2.97 4 3.9G 3.5G 4.0G 2.9G 3 6/wuy 7/wuy compute-0-1 busy 3.56 4 3.9G 3.8G 4.0G 3.1G 4 8/tester 9/tester 这是第一个脚本 第二个： 根据qstat -u ’*'和qstat -j jobid输出的结果，编一个脚本输出以下部分： job-ID name user state submit/start at queue slots reqtime elaptime -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 6 test1.sh wuy r 12/09/2012 14:47:26 all.q@compute-0-0.local 1 1:00:00 00:50:00 7 test4.sh wuy r 12/09/2012 14:47:26 all.q@compute-0-0.local 2 2:00:00 00:50:00 8 test2.sh tester r 12/09/2012 14:48:52 all.q@compute-0-1.local 2 5:00:00 00:48:34 9 test3.sh tester r 12/09/2012 14:48:52 all.q@compute-0-1.local 2 12:00:00 00:48:34 如果你觉得很容易，我可以给你提供个账号，你在机器上可以编写；方便的话，可把你的QQ号用站内消息发我，谢谢！ |
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