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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » qPCR怎样算出2-ΔΔCT值，还有标准差的那种？
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summer2771

木虫 (正式写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by gyesang at 2012-12-09 00:20:31
你说的不对，实验组和对照组要先去平均值再计算...

您是说先求出实验组和对照组ΔCT均值，然后用实验组均值减去对照组ΔCT均值？可是这样不就只有一个ΔΔCT值？我上面给出来的那个表可是有6个啊，实验组和对照组分别有3个的。
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11楼2012-12-09 01:34:15
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

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引用回帖:
11楼: Originally posted by summer2771 at 2012-12-09 01:34:15
您是说先求出实验组和对照组ΔCT均值，然后用实验组均值减去对照组ΔCT均值？可是这样不就只有一个ΔΔCT值？我上面给出来的那个表可是有6个啊，实验组和对照组分别有3个的。...

我这里这个你仔细看了没？

对照组3只老鼠
老鼠1 基因 - 内参 = ΔCT1
老鼠2 基因 - 内参 = ΔCT2
老鼠3 基因 - 内参 = ΔCT3
这里的三个ΔCT要取平均值了，重复的原则不就是让取均值吗 假设平均值为 ΔCT对照

实验组3只老鼠
老鼠1 基因 - 内参 = ΔCT1
老鼠2 基因 - 内参 = ΔCT2
老鼠3 基因 - 内参 = ΔCT3
这里的三个ΔCT也要取平均值 假设平均值为 ΔCT实验

然后进行ΔΔCT计算
       对照组ΔΔCT                             实验组ΔΔCT
ΔCT对照 - ΔCT对照(=0)             ΔCT实验 - ΔCT对照
然后算出以2（E）为base的指数2^-ΔΔCT
这里对照2^0=1,对照调为1
然后作图，不是两个Bar，你实验跟对照比吗？

[ Last edited by gyesang on 2012-12-9 at 14:55 ]
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12楼2012-12-09 14:53:20
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summer2771

木虫 (正式写手)
引用回帖:
12楼: Originally posted by gyesang at 2012-12-09 14:53:20
我这里这个你仔细看了没？

对照组3只老鼠
老鼠1 基因 - 内参 = ΔCT1
老鼠2 基因 - 内参 = ΔCT2
老鼠3 基因 - 内参 = ΔCT3
这里的三个ΔCT要取平均值了，重复的原则不就是让取均值吗 假设平均值为 ...

谢谢，我再看看！
不知道是不是我俩的意思不一致...呵呵
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13楼2012-12-09 19:25:24
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joan198108

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+1, 就是这个意思 2012-12-09 21:50:07
就是跟对照Δ一次，在样品里面设定一个作为标准，其他样品再跟标准Δ一次，然后通过2^-ΔΔCT
算出来就可以了
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14楼2012-12-09 20:22:20
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diandong

禁虫 (著名写手)
本帖内容被屏蔽
15楼2012-12-09 21:39:21
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gyesang

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引用回帖:
15楼: Originally posted by diandong at 2012-12-09 21:39:21
ΔΔCT计算
          对照                  实验
ΔCT对照 - ΔCT对照      ΔCT实验 - ΔCT对照
能具体说说是哪个计算？谢谢。

已经说的很具体啦，实在想不出来还要怎么说下去。
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16楼2012-12-09 21:51:01
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czcpudai

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by summer2771 at 2012-12-08 23:52:12
版主，就是您所说的这样！
现在就跟前面那个贴出来的图一样，是下面这样：
实验组   对照组
ΔCT1      ΔCT1
ΔCT2      ΔCT2  
ΔCT3      ΔCT3
既然ΔΔCT是等于实验组ΔCT-对照组ΔCT值，那么我不是可 ...

楼主，我觉得是这样子的，你说的“3+3+3=9个ΔΔCT值”这样理解是不正确的，因为这里每个“3”都是独立事件，不能同时发生的，但是如果你是单独来做，我觉得还是可以的
实验组   对照组
a-ΔCT1     b-ΔCT1
c-ΔCT2     d-ΔCT2  
e-ΔCT3     f-ΔCT3
比如，你用a-b，c-d，e-f来做ΔΔCT可以，或者你用a-b，c-d，e-f也可以，总之，最后分析的时候你只能使用其中的一种情况来分析，我觉得是这样子的。
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17楼2013-01-05 16:20:27
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东方寂痕

银虫 (初入文坛)
顶起！
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18楼2014-03-03 16:14:39
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1031409614

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
17楼: Originally posted by czcpudai at 2013-01-05 16:20:27
楼主，我觉得是这样子的，你说的“3+3+3=9个ΔΔCT值”这样理解是不正确的，因为这里每个“3”都是独立事件，不能同时发生的，但是如果你是单独来做，我觉得还是可以的
实验组   对照组
a-ΔCT1     b-ΔCT1
c ...

你好，我的观点也是这样子的，也是按这种方法算的，这种方法到底对不对？如果做柱状图的话对照组的标准差又该怎么算？
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19楼2015-11-29 18:14:50
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