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shiyanmeixy

新虫 (小有名气)

[求助] 谁能帮我分析一下我的氨基酸序列中的信号肽在哪?非常感谢。 已有1人参与

各位前辈们,大家好,我现的想找出氨基酸序列中的信号肽,不太会,谁能帮我找一下,谢谢!
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  • 附件 1 : 氨基酸序列.txt
  • 2012-11-28 14:37:54, 1.54 K

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sarah-miao

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
# Sequence Length: 524
# Sequence Number of predicted TMHs:  1
# Sequence Exp number of AAs in TMHs: 35.80804
# Sequence Exp number, first 60 AAs:  0.09302
# Sequence Total prob of N-in:        0.14669
Sequence        TMHMM2.0        outside             1   469
Sequence        TMHMM2.0        TMhelix           470   492
Sequence        TMHMM2.0        inside           493   524
仅供参考哈
2楼2012-11-28 15:24:37
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shiyanmeixy

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by sarah-miao at 2012-11-28 15:24:37
# Sequence Length: 524
# Sequence Number of predicted TMHs:  1
# Sequence Exp number of AAs in TMHs: 35.80804
# Sequence Exp number, first 60 AAs:  0.09302
# Sequence Total prob of N-in:        0 ...

谢谢您!没有太理解这个,# Sequence Exp number of AAs in TMHs: 35.80804。# Sequence Exp number, first 60 AAs:  0.09302是什么意思?
这个与我用signalP分析的结果不一样,signalP的结果说是我的序列没有信号肽,但是我的应该属于分泌蛋白,感觉应该有。我是刚做这个,懂的太少。
3楼2012-11-28 21:16:21
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sarah-miao

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

内容已删除
4楼2012-11-29 00:01:46
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shiyanmeixy

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by sarah-miao at 2012-11-29 00:01:46
回头在帮你看看,我用一个在线网站分子的,有个图显示存在信号肽的

好的,非常感谢你!
5楼2012-11-29 09:04:06
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sarah-miao

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by shiyanmeixy at 2012-11-28 21:16:21
谢谢您!没有太理解这个,# Sequence Exp number of AAs in TMHs: 35.80804。# Sequence Exp number, first 60 AAs:  0.09302是什么意思?
这个与我用signalP分析的结果不一样,signalP的结果说是我的序列没有信号 ...

用的TMHMM2.0分析的,是一个在线分析网站
Sequence        TMHMM2.0        outside             1   469
Sequence        TMHMM2.0        TMhelix           470   492
Sequence        TMHMM2.0        inside           493   524
http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/,已上传图片,你可以参考一下看看

Sequence.gif

6楼2012-11-29 10:41:52
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shiyanmeixy

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by sarah-miao at 2012-11-29 10:41:52
用的TMHMM2.0分析的,是一个在线分析网站
Sequence        TMHMM2.0        outside             1   469
Sequence        TMHMM2.0        TMhelix           470   492
Sequence        TMHMM2.0        inside           493   524
http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/, ...

好,你太好了,谢谢你!祝你实验顺利!
7楼2012-11-29 20:20:20
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diandong

禁虫 (著名写手)

本帖内容被屏蔽

8楼2012-11-29 21:34:03
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sarah-miao

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by shiyanmeixy at 2012-11-29 20:20:20
好,你太好了,谢谢你!祝你实验顺利!...

呵呵,客气啦,也不知道是不是呢,希望对你有用吧

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
9楼2012-11-29 22:28:06
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diandong

禁虫 (著名写手)

感谢参与,应助指数 +1
本帖内容被屏蔽

10楼2012-11-30 11:10:33
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