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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 谁能帮我分析一下我的氨基酸序列中的信号肽在哪？非常感谢。
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shiyanmeixy

新虫 (小有名气)

[求助] 谁能帮我分析一下我的氨基酸序列中的信号肽在哪？非常感谢。 已有1人参与

各位前辈们，大家好，我现的想找出氨基酸序列中的信号肽，不太会，谁能帮我找一下，谢谢！
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  • 附件 1 : 氨基酸序列.txt
    • 2012-11-28 14:37:54, 1.54 K

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1楼 2012-11-28 14:39:39
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sarah-miao

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
# Sequence Length: 524
# Sequence Number of predicted TMHs:  1
# Sequence Exp number of AAs in TMHs: 35.80804
# Sequence Exp number, first 60 AAs:  0.09302
# Sequence Total prob of N-in:        0.14669
Sequence        TMHMM2.0        outside             1   469
Sequence        TMHMM2.0        TMhelix           470   492
Sequence        TMHMM2.0        inside           493   524
仅供参考哈
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2楼2012-11-28 15:24:37
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shiyanmeixy

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by sarah-miao at 2012-11-28 15:24:37
# Sequence Length: 524
# Sequence Number of predicted TMHs:  1
# Sequence Exp number of AAs in TMHs: 35.80804
# Sequence Exp number, first 60 AAs:  0.09302
# Sequence Total prob of N-in:        0 ...

谢谢您！没有太理解这个，# Sequence Exp number of AAs in TMHs: 35.80804。# Sequence Exp number, first 60 AAs:  0.09302是什么意思？
这个与我用signalP分析的结果不一样，signalP的结果说是我的序列没有信号肽，但是我的应该属于分泌蛋白，感觉应该有。我是刚做这个，懂的太少。
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3楼2012-11-28 21:16:21
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sarah-miao

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

内容已删除
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4楼2012-11-29 00:01:46
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shiyanmeixy

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by sarah-miao at 2012-11-29 00:01:46
回头在帮你看看，我用一个在线网站分子的，有个图显示存在信号肽的

好的，非常感谢你！
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5楼2012-11-29 09:04:06
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sarah-miao

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by shiyanmeixy at 2012-11-28 21:16:21
谢谢您！没有太理解这个，# Sequence Exp number of AAs in TMHs: 35.80804。# Sequence Exp number, first 60 AAs:  0.09302是什么意思？
这个与我用signalP分析的结果不一样，signalP的结果说是我的序列没有信号 ...

用的TMHMM2.0分析的，是一个在线分析网站
Sequence        TMHMM2.0        outside             1   469
Sequence        TMHMM2.0        TMhelix           470   492
Sequence        TMHMM2.0        inside           493   524
http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/，已上传图片，你可以参考一下看看

Sequence.gif
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6楼2012-11-29 10:41:52
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shiyanmeixy

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by sarah-miao at 2012-11-29 10:41:52
用的TMHMM2.0分析的，是一个在线分析网站
Sequence        TMHMM2.0        outside             1   469
Sequence        TMHMM2.0        TMhelix           470   492
Sequence        TMHMM2.0        inside           493   524
http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/， ...

好，你太好了，谢谢你！祝你实验顺利！
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7楼2012-11-29 20:20:20
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diandong

禁虫 (著名写手)
本帖内容被屏蔽
8楼2012-11-29 21:34:03
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sarah-miao

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by shiyanmeixy at 2012-11-29 20:20:20
好，你太好了，谢谢你！祝你实验顺利！...

呵呵，客气啦，也不知道是不是呢，希望对你有用吧

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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9楼2012-11-29 22:28:06
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diandong

禁虫 (著名写手)
感谢参与，应助指数 +1
本帖内容被屏蔽
10楼2012-11-30 11:10:33
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