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蓝白斑筛选没问题,挑白色克隆测序无目的基因序列
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201014162
金虫
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在线: 148.3小时
虫号: 1200862
[交流]
蓝白斑筛选没问题,挑白色克隆测序无目的基因序列
最近在做克隆测序,先PCR产物纯化后连接载体PMD18-T,然后转化到JM1O9的感受态细胞,蓝白斑筛选蓝色和白色都有菌落,挑白色菌落培养后送上海生工测序,用的通用引物M13,结果上vecscreen比对,大部分不包含我的目的基因序列,相似度最大的竟然是PBR322载体,很郁闷,测了好多次了都这样,请高手指教!
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1楼
2012-11-27 16:21:44
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jw1985629
新虫
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不要只挑白斑后摇菌就送出去测序,要自己先做菌体PCR或者酶切跑胶鉴定下再送出去,你这种情况应该是酶切后没做胶回收直接连接了吧?我之前遇见过。希望能帮到你
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7楼
2012-11-28 20:41:00
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zhaodahe
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前确定下是没插入的假阳性,还是PCR 产物不纯连入了非特异条带。前者的话,就是实验技巧的问题;更可能是后者,你把扩增的片段切胶回收后再连。
[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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2楼
2012-11-27 18:50:37
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cicelyzh
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
如果假阳性很多,可能是克隆的目的片段有问题,最好重新做一下。一般挑了白斑克隆后提下质粒酶切鉴定后再送测序。
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3楼
2012-11-28 08:31:12
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201014162
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2楼
:
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zhaodahe
at 2012-11-27 18:50:37
前确定下是没插入的假阳性,还是PCR 产物不纯连入了非特异条带。前者的话,就是实验技巧的问题;更可能是后者,你把扩增的片段切胶回收后再连。
恩 我是PCR产物切胶回收后再做的连接,如果假阳性的话那在vecscreen上检索的话是不是应该也能检索的序列,我的结果都在PBR322载体的序列,
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4楼
2012-11-28 16:29:49
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