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Gina88

木虫 (正式写手)

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8楼: Originally posted by likai0106 at 2012-11-29 08:23:09
第一,首先MS导出的结构不一定是最优的,多少和优化的有区别。
第二,改源代码的vasp一定是重新编译,constr_cell_relax.F中,楼主看注释,就能知道,比较简单
第三,这个我没有试过,建议楼主试一下,有结果请楼 ...

我研究的体系的确重构了。
11楼2012-11-29 14:21:51
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likai0106

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
fzx2008: 金币+1, 谢谢指教! 2012-11-29 16:41:52
Gina88: 金币+3, ★★★很有帮助 2012-11-30 11:35:44
引用回帖:
11楼: Originally posted by Gina88 at 2012-11-29 14:21:51
我研究的体系的确重构了。...

如果有重构,建议楼主简单做一下分子动力学的计算,在重构的位置出结构之后在vasp中进行优化这样比楼主直接去做单层的计算简单而实际得多。
12楼2012-11-29 15:39:17
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Gina88

木虫 (正式写手)

引用回帖:
12楼: Originally posted by likai0106 at 2012-11-29 15:39:17
如果有重构,建议楼主简单做一下分子动力学的计算,在重构的位置出结构之后在vasp中进行优化这样比楼主直接去做单层的计算简单而实际得多。...

您的意思是:
1.如果不重构,那就先对体结构进行优化,在优化的体结构上裁出低维结构,然后再计算低维结构的性质。那在裁出低维结构后,要不要再优化一次后再计算性质呢?
2.如果有重构,那就用分子动力学计算,得到重构结构后再进行优化,之后计算性质?那您所说的分子动力学计算是用vasp中的第一性原理分子动力学计算呢,还是用经典的分子动力学计算呢?好像vasp中的第一性原理分子动力学计算很耗时啊。还有,如果用分子动力学计算后,应该从哪个文件得到新的结构呢。我对分子动力学不太了解,所以问的问题比较小白,还望多多包涵啊:)
13楼2012-11-30 11:45:42
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likai0106

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
liliangfang: 金币+2, 谢谢交流 2012-12-01 20:19:56
Gina88: 金币+3, ★★★很有帮助 2012-12-02 10:31:29
引用回帖:
13楼: Originally posted by Gina88 at 2012-11-30 11:45:42
您的意思是:
1.如果不重构,那就先对体结构进行优化,在优化的体结构上裁出低维结构,然后再计算低维结构的性质。那在裁出低维结构后,要不要再优化一次后再计算性质呢?
2.如果有重构,那就用分子动力学计算, ...

1.优化体结构截出的便面只能说是晶格参数比较准确,但是对于表面有没有突起还不能确定,所以对于表面还有优化,但是此时尽量不要用ISIF=3,因为真空层会变,严重的会被原子填满。
2.分子动力学用经典力场去找就行,因为我们只是想确定那个点,最终还是要对那个点做量子计算。所以粗略的找到就行。动力学我也不熟悉只是听报告的时候有人说过,这个本人能力有限不能一一解答了。
14楼2012-12-01 09:57:27
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Gina88

木虫 (正式写手)

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14楼: Originally posted by likai0106 at 2012-12-01 09:57:27
1.优化体结构截出的便面只能说是晶格参数比较准确,但是对于表面有没有突起还不能确定,所以对于表面还有优化,但是此时尽量不要用ISIF=3,因为真空层会变,严重的会被原子填满。
2.分子动力学用经典力场去找就行 ...

那您用过分子动力学吗,您是用的什么软件的什么力场去算啊,还有怎么确定那个点啊?
15楼2012-12-02 10:34:22
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likai0106

金虫 (小有名气)

引用回帖:
15楼: Originally posted by Gina88 at 2012-12-02 10:34:22
那您用过分子动力学吗,您是用的什么软件的什么力场去算啊,还有怎么确定那个点啊?...

没有用过,但是报告的人说可以通过势能曲线简单的看出极小值点,因为重构的结构无非也就是体系的极小值点。只要范围确定,就好做了。具体过程我也没有做过,不好意思。希望对你有帮助
16楼2012-12-03 13:55:26
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Gina88

木虫 (正式写手)

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16楼: Originally posted by likai0106 at 2012-12-03 13:55:26
没有用过,但是报告的人说可以通过势能曲线简单的看出极小值点,因为重构的结构无非也就是体系的极小值点。只要范围确定,就好做了。具体过程我也没有做过,不好意思。希望对你有帮助...

那个能看出极小值点的势能曲线是通过分子动力学得到的吗?
是不是得到了那个范围,将结构调整到那个范围,然后优化就可以得到重构结构了?
谢谢!
17楼2012-12-04 13:38:44
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likai0106

金虫 (小有名气)

引用回帖:
17楼: Originally posted by Gina88 at 2012-12-04 13:38:44
那个能看出极小值点的势能曲线是通过分子动力学得到的吗?
是不是得到了那个范围,将结构调整到那个范围,然后优化就可以得到重构结构了?
谢谢!...

是的,如果结果在那个范围内一定能得到其另一种极小值结构(重构结构)。
18楼2012-12-06 13:52:44
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852366016

金虫 (正式写手)

送红花一朵
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9楼: Originally posted by cclw at 2012-11-29 08:44:58
解决的方法用ISIF=2,ISIF=2与3的差别就是基矢是否优化。
对于二维材料,真空方向(假定是c方向)优化是没有物理意义的。楼主可以在ISIF=2的情况下,先粗略优化原子坐标;然后修改并优化基矢a和b,就可以得到最终的优 ...

请问您说的优化基失a和b 是手动改变晶格常数进行优化的意思吗
要么读书要么旅行。
19楼2018-09-14 16:47:34
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