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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » gauss cube=(full,Cards) 的得到电子总数 不等于 原子总电子数目。
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nodding

木虫 (小有名气)

[交流] gauss cube=(full,Cards) 的得到电子总数 不等于 原子总电子数目。

我计算单个原子 Al 的电子分布情况，
输入文件为：
# b3lyp/3-21g cube=(full,cards)

Title Card Required

0 2
Al 0. 0. 0.

full.cube
-1 -4.0495 -4.0495 -4.0495
64 0.130629 0.0 0.0
64 0.0 0.130629 0.0
64 0.0 0.0 0.130629

结果把 full.cube 中所用格点的电子密度积分后，发现电子总数 为27 ，比Al 原子电子总数 高出约 2倍。

请问 哪里出了问题？ 多谢您的关注和指点。
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1楼 2012-11-24 20:17:09
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zhou2009

版主 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
资料已发。

其实，计算分子的电子密度不是目的，它的图像是圆滚滚地，什么信息也看不见，最终目的是要作电子密度差Δρ。
作电子密度差Δρ：
见Multiwfn作者Sobereva博士写的的帖子“使用Multiwfn作电子密度差图”：
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3980314
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22楼2012-11-26 15:23:54
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lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
nodding(金币+1): 谢谢参与
nodding: 金币+3 2012-11-25 12:16:55
首先不知道楼主如何做的积分，其次27是不是相对质量囧
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5楼2012-11-25 10:12:04
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zhou2009

版主 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
nodding(金币+1): 谢谢参与
nodding: 金币+5 2012-11-25 12:17:03
gmy1990: 金币+2 2012-11-26 09:41:59
你如何把 full.cube 中所用格点的电子密度积分的？
cube已经是离散的数字了，需要把每一个数字乘以微体积元，再将它们加和起来，就得到电子数。这在excel中很容易操作。
因为cube是用原子单位表示的，微体积元要用波尔为单位的数据。
如果用埃为单位的，数值就会差约一倍。你是否误用了埃为单位的微体积元？
在multiwfn的处理结果中，用波尔为单位的数据和用埃为单位的都列出了。
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10楼2012-11-25 11:03:34
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nodding

木虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by lishijunzong at 2012-11-25 10:12:04
首先不知道楼主如何做的积分，其次27是不是相对质量囧

我把 格点电荷密度分布* 每个格点体积 然后求和  得到 总的电子数。

27不是相对质量。
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11楼2012-11-25 11:06:22
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假大空6楼
2012-11-25 10:18   回复  
nodding(金币+1): 谢谢参与
userhung13楼
2012-11-25 11:35   回复  
nodding(金币+1): 谢谢参与
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