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LAMMPS并行计算的问题（cpu——time关系）
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刚买了个服务器，6核4线程的，安装好并行版lammps后运行如下： mpirun -np 1 ./lmp 我们进行了测试了time —— cpu的数目关系，如上传图片 （1）怎么发现24个cpu全用上，计算所用的时间和2个cpu 的一样，这是什么原因啊。 （2）随着cpu从1到24变化，时间time会出现波动，一会大一会小的。测试结果是随机的还是差不多都一样呢？请问正常的情况应该是什么样子呢？ （3）有朋友说是因为体系大小的原因，请问一下用过lammps并行版的牛人们，你们是怎么测试和分配的呢？ （4）有没有好的软件专门进行并行测试的？（我感觉是不是因为计算机并行没有装好）  cpu-time.jpg |
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我从分子模拟论坛里看到这个 http://www.mdbbs.org/thread-19233-1-1.html "主要是因为Linux的内核有两种，一是.elsmp，一是el，前者是symmetric multiprocessing对称对处理器，后者是uniprocessor单处理器。而我启动Linux时，选择的是后者，所以并行的核越多，速度越慢。因此，要并行的话，应该选择elsmp才对。" 可是我的LINUX装的是 ubuntu-10.04.4,开机的是候没有上面所说的两个选项,请问是不是这个原因呢? ubuntu不支持el吗 ?怎么进行设置呢? |
16楼2012-11-24 15:55:46
043114076
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