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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 随机引物获得的片段测序效果不好
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longyh6411

金虫 (小有名气)

[求助] 随机引物获得的片段测序效果不好

使用随机引物做PCR，获得的片段胶回收后送测序效果很不好，可能是引物与模板结合能力太差了。我想将引物5‘端缩短，做PCR的时候用原来的引物，而在测序的时候使用相应的缩短5'端的引物来测，是否会对测序效果有帮助呢？
或者请教遇到过类似问题的前辈指教是否有别的办法可以解决这个问题？
另外，将PCR产物克隆到载体，然后用通用引物测序这途径不考虑，因为我样太多太费时间
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1楼 2012-11-18 22:55:12
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zhaodahe

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
longyh6411: 金币+50, ★有帮助 2012-11-24 15:44:03
建议还是做克隆，随机引物扩增效率不高，而且有很多杂带，用扩增产物直接测序难免出问题。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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2楼2012-11-19 08:31:07
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