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xiaoluoj

金虫 (正式写手)

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[求助] VESTA可视化CHG的单位是什么

自洽计算得到CHG，用VESTA打开，查看Isosurface（如下图），最大值才0.54，但是查看CHG文件发现最大值有的都超过了2000
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200  200  192
  20.506    20.610    21.071    22.262    24.571    28.168    32.917    38.583    45.244    53.605
  64.975    80.907    102.61    130.44    163.92    202.79    248.41    304.75    378.11    475.60
  602.94    762.33    951.61    1165.3    1396.7    1640.2    1889.7    2137.6    2371.6    2575.2
  2729.5    2817.6    2828.7    2761.3    2623.7    2431.6    2204.1    1958.6    1708.3    1462.0
  1226.1    1007.4    813.33    650.06    520.47    423.09    353.14    304.76    272.90    254.46
  248.15    253.72    271.39    302.30    349.30    417.14    511.50    637.14    795.77    984.82
  1198.2    1428.2    1667.9    1910.3    2146.7    2364.6    2547.6    2678.3    2742.1    2731.2
  2647.2    2500.0    2305.4    2080.8    1841.8    1599.9    1363.0    1137.3    928.95    744.73
  589.95    466.50    371.94    300.54    245.37    200.43    162.01    128.93    101.53    80.216
  64.588    53.405    45.128    38.485    32.818    28.076    24.502    22.224    21.058    20.608
  20.506    20.610    21.071    22.262    24.571    28.168    32.917    38.583    45.244    53.605
  64.975    80.907    102.61    130.44    163.92    202.79    248.41    304.75    378.11    475.60
  602.94    762.33    951.61    1165.3    1396.7    1640.2    1889.7    2137.6    2371.6    2575.2 - - - - -

我的问题是在CHG可视化的过程中经过什么单位转换吗

360截图20121118205331171.jpg

[ Last edited by xiaoluoj on 2012-11-18 at 21:49 ]

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1楼 2012-11-18 20:58:42

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sungjen

银虫 (著名写手)

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引用回帖:

7楼: Originally posted by xiaoluoj at 2013-10-31 20:58:57
将CHG拖入VESTA中，软件默认滴将CHG中的数据除以模型体积（不一定是单胞吧，如果模型是超胞，应该除以超胞的体积），然后再乘以0.53*0.53*0.53（将长度单位改为玻尔半径）...

额，您说的这个什么意思呢，我的意思是在知道了文献中的isosurface的值，如何填写VESTA里的值？
请另一个问题是我想画三维电荷密度图如何画呢我用VESTA画的图没有化学键，而且别人的晶胞在立方体外部还有延伸出来化学键和原子？请问这个是怎么做到的呢