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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » VESTA可视化CHG的单位是什么
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xiaoluoj

金虫 (正式写手)

[求助] VESTA可视化CHG的单位是什么

自洽计算得到CHG，用VESTA打开，查看Isosurface（如下图），最大值才0.54，但是查看CHG文件发现最大值有的都超过了2000
--------------------------------------------------------------------------------------------
200  200  192
  20.506      20.610      21.071      22.262      24.571      28.168      32.917      38.583      45.244      53.605   
  64.975      80.907      102.61      130.44      163.92      202.79      248.41      304.75      378.11      475.60   
  602.94      762.33      951.61      1165.3      1396.7      1640.2      1889.7      2137.6      2371.6      2575.2   
  2729.5      2817.6      2828.7      2761.3      2623.7      2431.6      2204.1      1958.6      1708.3      1462.0   
  1226.1      1007.4      813.33      650.06      520.47      423.09      353.14      304.76      272.90      254.46   
  248.15      253.72      271.39      302.30      349.30      417.14      511.50      637.14      795.77      984.82   
  1198.2      1428.2      1667.9      1910.3      2146.7      2364.6      2547.6      2678.3      2742.1      2731.2   
  2647.2      2500.0      2305.4      2080.8      1841.8      1599.9      1363.0      1137.3      928.95      744.73   
  589.95      466.50      371.94      300.54      245.37      200.43      162.01      128.93      101.53      80.216   
  64.588      53.405      45.128      38.485      32.818      28.076      24.502      22.224      21.058      20.608   
  20.506      20.610      21.071      22.262      24.571      28.168      32.917      38.583      45.244      53.605   
  64.975      80.907      102.61      130.44      163.92      202.79      248.41      304.75      378.11      475.60   
  602.94      762.33      951.61      1165.3      1396.7      1640.2      1889.7      2137.6      2371.6      2575.2   - - - - -

   我的问题是在CHG可视化的过程中经过什么单位转换吗

360截图20121118205331171.jpg

[ Last edited by xiaoluoj on 2012-11-18 at 21:49 ]
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1楼2012-11-18 20:58:42
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jpchou

专家顾问 (著名写手)
樓上正解
請去讀 VESTA 手冊
17.4.3 Structural and volumetric data
下面的 46. VASP
裡面有詳細說明

順道一提
把 CHGCAR ?G進 VESTA
初始值(isovalue, 在 VESTA 內是叫 level)
VESTA 會自動產生
這個值是可調控
會影響到畫出?淼� isosurface 模樣
其預設值是怎計算呢
在手冊內的 16.7 Default isosurface level
有詳細的公式說明
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8楼2013-11-01 04:53:19
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xiaoluoj

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by sungjen at 2013-10-31 14:03:31
不知道楼主解决了吗 在知道isosurface值得情况下，这个值和VESTA里的值单位一样吗

将CHG拖入VESTA中，软件默认滴将CHG中的数据除以模型体积（不一定是单胞吧，如果模型是超胞，应该除以超胞的体积），然后再乘以0.53*0.53*0.53（将长度单位改为玻尔半径）
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7楼2013-10-31 20:58:57
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普通回帖

anlen0615
2楼2012-11-19 08:59:16
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xiaoluoj

金虫 (正式写手)
补张图   http://good.gd/2308999.htm
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3楼2012-11-19 11:53:36
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tiaozaoququ

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
xiaoluoj: 金币+3, ★有帮助 2012-11-20 13:46:35
e/A^3, A为长度单位埃
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再牛逼的选择也需要更傻逼的坚持
4楼2012-11-20 09:27:41
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xiaoluoj

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by tiaozaoququ at 2012-11-20 09:27:41
e/A^3, A为长度单位埃

还是有些疑惑，见我的帖子http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=5197667
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5楼2012-11-20 13:47:10
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sungjen

银虫 (著名写手)
不知道楼主解决了吗 在知道isosurface值得情况下，这个值和VESTA里的值单位一样吗
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希望有一天成为大神
6楼2013-10-31 14:03:31
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sungjen

银虫 (著名写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by xiaoluoj at 2013-10-31 20:58:57
将CHG拖入VESTA中，软件默认滴将CHG中的数据除以模型体积（不一定是单胞吧，如果模型是超胞，应该除以超胞的体积），然后再乘以0.53*0.53*0.53（将长度单位改为玻尔半径）...

额，您说的这个什么意思呢 ，我的意思是在知道了文献中的isosurface的值，如何填写VESTA里的值？
请另一个问题是我想画三维电荷密度图 如何画呢 我用VESTA画的图没有化学键，而且别人的晶胞在立方体外部还有延伸出来化学键和原子？请问这个是怎么做到的呢
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希望有一天成为大神
9楼2013-11-01 09:35:40
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sungjen

银虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by jpchou at 2013-11-01 04:53:19
樓上正解
請去讀 VESTA 手冊
17.4.3 Structural and volumetric data
下面的 46. VASP
裡面有詳細說明

順道一提
把 CHGCAR ?G進 VESTA
初始值(isovalue, 在 VESTA 內是叫 level)
VESTA 會自動產生
這個 ...

额，我看了下那个  但是文献上给了isosurface的值，是不是直接输入进去那个level 地方呢 ？还是要转化下呢
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希望有一天成为大神
10楼2013-11-01 09:58:41
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