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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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zywang0818

金虫 (小有名气)

[求助] 100金币求晶体对称操作

老外给的审稿意见如下：Two independent molecules have to be positioned
in ONE asymmetric part of the unit cell, i.e. they have to be positioned
as close to each other as possible. Actually, you need change
the atomic coordinates for one molecule by symmetry operation
to move it closer to another independent molecule.
Then prepare new Figure 1.
我是学有机化学的，搞一上午也没搞清楚怎么搞symmetry operation
，100金币跪求各位大侠帮忙！
Fig.1 The title molecule(I) showing 30 % probability displacement ellipsoids.jpg
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  • 附件 1 : 100114c_0m.cif
    • 2012-11-18 12:04:22, 22.28 K

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1楼 2012-11-18 12:05:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wwyygg0520

新虫 (文坛精英)

头大不怕雨淋

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你一个晶胞中含有8个分子，除了你给出的，其它可以通过对称操作得到原子坐标。
审稿人的意思是，你没必要选择这么远的两个单元，完全可以用离得更近的两个单元表示出所有的原子。
你也不必搞什么对称操作，只需要找个画晶体结构的软件如Atoms，Diamond等等去弄即可，不难。
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2楼2012-11-18 12:21:05
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羊倌

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
不对称单位选择不合适，文件传给我，我给你做一下
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准备架人
3楼2012-11-18 12:39:22
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zywang0818

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wwyygg0520 at 2012-11-18 12:21:05
你一个晶胞中含有8个分子，除了你给出的，其它可以通过对称操作得到原子坐标。
审稿人的意思是，你没必要选择这么远的两个单元，完全可以用离得更近的两个单元表示出所有的原子。
你也不必搞什么对称操作，只需要 ...

我打开cif 可以看见2个分子，我就把这两个分子画出来了。我投的是ACTA E ，要求用xp画个30%的椭球图。你能根据审稿人的意见，帮我画一下吗？不甚感激!
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4楼2012-11-18 12:40:42
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zywang0818

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 羊倌 at 2012-11-18 12:39:22
不对称单位选择不合适，文件传给我，我给你做一下

文件已经上传了，在附件1，非常感谢！
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5楼2012-11-18 12:43:04
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羊倌

至尊木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wwyygg0520 at 2012-11-18 12:21:05
你一个晶胞中含有8个分子，除了你给出的，其它可以通过对称操作得到原子坐标。
审稿人的意思是，你没必要选择这么远的两个单元，完全可以用离得更近的两个单元表示出所有的原子。
你也不必搞什么对称操作，只需要 ...

100114c_0m.jpg(32.53KB)
http://kuai.xunlei.com/d/GLTKXIXLHVZS?p=130497
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准备架人
6楼2012-11-18 12:51:43
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羊倌

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
zywang0818: 金币+100, ★★★★★最佳答案, 金币已送出，非常感谢，还有一些细节问题想请教您，可方便告知QQ或手机号码？ 2012-11-18 13:04:35
m.jpg(36.09KB)
http://kuai.xunlei.com/d/GWICLJNPUOOH?p=130497
m.jpg(36.09KB)
http://kuai.xunlei.com/d/GWICLJNPUOOH?p=130497
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准备架人
7楼2012-11-18 12:56:29
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薛定谔龙猫

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wwyygg0520 at 2012-11-18 12:21:05
你一个晶胞中含有8个分子，除了你给出的，其它可以通过对称操作得到原子坐标。
审稿人的意思是，你没必要选择这么远的两个单元，完全可以用离得更近的两个单元表示出所有的原子。
你也不必搞什么对称操作，只需要 ...

从什么地方可以看出一个晶胞中有8个分子？
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8楼2012-11-19 11:32:41
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wwyygg0520

新虫 (文坛精英)

头大不怕雨淋
引用回帖:
8楼: Originally posted by 薛定谔龙猫 at 2012-11-19 11:32:41
从什么地方可以看出一个晶胞中有8个分子？...

cif里面写着z＝8..............
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9楼2012-11-19 14:14:58
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