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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » NCBI比对出现非常规结果 请高手指点
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chchqq

银虫 (小有名气)

[求助] NCBI比对出现非常规结果 请高手指点

NCBI比对一条序列时，比对结果出现了以上一段结果。问题是，Query中“ccaaataaaagtcaaagaagacactcaagaaat” 这段是小写的，其他的都是大写的。这个小写不知代表什么特殊的含义，有知道的吗？ 请高手指教

ncbi blast.PNG
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1楼 2012-11-17 15:29:17
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yixuanwin

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
看天: 金币+2, 多谢回答 2012-11-17 21:51:19
chchqq: 金币+4, ★★★很有帮助, 3 Q 2012-11-18 09:06:20
表示：Low complexity regions
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2012-11-17 18:34:55
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看天

木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chchqq: 金币+2, ★有帮助, 3 Q 2012-11-18 09:06:36
我前两天刚发一个类似的帖子，你可以看看：
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=5165417

这表示你比对的序列中的那一段（小写灰色）的序列是比较简单的，即楼上说的“低复杂区“，提醒你注意一下而已
赞一下(2人) 回复此楼
戒嗔怒以养肝气，省言语以养神气，多读书以养质气，顺时令以养元气，不拘节以养大气，观天变以养灵气，莫强求规于运气。
3楼2012-11-17 21:54:05
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