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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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fddyn

版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

[求助] 新手求通过marker估计下dna浓度

用传统方法手提的土壤微生物dna,杂质含量太高测浓度的ND-1000分光光度计测出来不准,故想通过跑胶与marker比较估计个大概浓度,也好知道纯化的回收率,谢谢
Q1--Q5 均为qiagen胶回收试剂盒纯化后的样品,marker(M)在中间,1--8为粗提产物
样品上样量为 :5ul
marker上样量为:5ul
marker用的是 Lambda DNA/Hind III Marker,上样6ul时 23130bp (最后那条)是238.4ng,9416bp(倒数第二条)是97.1ng

2012.11.09---.JPG
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fddyn

兑换贵宾

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引用回帖:
15楼: Originally posted by 375697868 at 2013-10-14 13:13:16
你好!胶照相的里面有个浓度对比软件了,可以参考一下。另外,我看到你的Lambda DNA/Hind III Marker跑的比我的好的多,我想问下你胶浓度和电压分别是好多,跑了好长时间呢?非常感谢!

我们跑20kb的片段,一般用80v的电压,跑25min,胶浓度0.5-1%都试过,感觉差别不大,主要是后来要切胶纯化,0.5%的太软了不好切,又回1%的胶了
要是跑pcr的(300-500bp的,我们p的一般都这么大片段的),就110-120v的电压,20min,1%的胶
16楼2013-10-15 18:44:31
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fddyn

超级版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

再补充点,跑的是0.5%的琼脂糖胶
为什么纯化后比纯化前看上去片段大呐
2楼2012-11-16 19:24:10
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cicelyzh

管理员

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
fddyn: 金币+3, 有帮助 2012-11-17 23:47:00
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-11-19 13:59:23
marker9kb与23kb的带跑得不是很开,而且浓度明显比样品高。可以考虑少上点marker,电泳时间长一点再看。从目前的粗略估计,大概浓度在大约6ng/ul。
纯化前的样品杂质多,浓度较高,条带笑脸,电泳的表观分子量稍微偏小是很正常的。
3楼2012-11-17 08:00:16
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elbo

实习版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

貌似片段小于23kb,请问胶上面的标记是怎么弄的,谢谢。
4楼2012-11-17 08:04:35
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