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fddyn

金虫 (小有名气)

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[求助] 新手求通过marker估计下dna浓度

用传统方法手提的土壤微生物dna，杂质含量太高测浓度的ND-1000分光光度计测出来不准，故想通过跑胶与marker比较估计个大概浓度，也好知道纯化的回收率，谢谢
Q1--Q5 均为qiagen胶回收试剂盒纯化后的样品，marker（M）在中间，1--8为粗提产物
样品上样量为：5ul
marker上样量为：5ul
marker用的是 Lambda DNA/Hind III Marker，上样6ul时 23130bp （最后那条）是238.4ng，9416bp（倒数第二条）是97.1ng

2012.11.09---.JPG

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1楼 2012-11-16 19:22:15

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fddyn

金虫 (小有名气)

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引用回帖:

15楼: Originally posted by 375697868 at 2013-10-14 13:13:16
你好！胶照相的里面有个浓度对比软件了，可以参考一下。另外，我看到你的Lambda DNA/Hind III Marker跑的比我的好的多，我想问下你胶浓度和电压分别是好多，跑了好长时间呢？非常感谢！

我们跑20kb的片段，一般用80v的电压，跑25min，胶浓度0.5-1%都试过，感觉差别不大，主要是后来要切胶纯化，0.5%的太软了不好切，又回1%的胶了
要是跑pcr的（300-500bp的，我们p的一般都这么大片段的），就110-120v的电压，20min，1%的胶