[交流] 怎么建系统进化树

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1楼2012-11-15 12:03:43

vir2008

木虫 (著名写手)

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用软件。
不很难，我们实验室有人做过。

2楼2012-11-15 14:36:31

乐乐3952

铁杆木虫 (正式写手)

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可以用mega，这个做进化树比较好，http://ishare.iask.sina.com.cn/f/34612576.html

3楼2012-11-15 15:13:30

kingleo99

木虫 (小有名气)

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参考这个帖子，里面将系统进化树，序列提交，以及分析都给了分析。http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3590809

4楼2012-11-15 16:02:13

吕好新

金虫 (小有名气)

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5楼2012-11-16 10:42:01

吕好新

金虫 (小有名气)

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6楼2012-11-16 10:42:32

nancyyazi

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先用CLUSTAL比对，然后用MEGA建树。建树用的菌株序列可以从LPSN下载标准菌株序列

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zxy664063437

7楼2012-11-16 11:22:04

zxy664063437

新虫 (初入文坛)

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引用回帖:

7楼: Originally posted by nancyyazi at 2012-11-16 11:22:04
先用CLUSTAL比对，然后用MEGA建树。建树用的菌株序列可以从LPSN下载标准菌株序列

是不是每个测序的菌株都要一个参考菌株啊

8楼2012-11-16 21:49:56

黑藻先生

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其实MEGA就可以直接比对的样子...................
所以一般一个MEGA就够了吧=。=

9楼2012-12-10 16:15:35