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zxy664063437

新虫 (初入文坛)


[交流] 怎么建系统进化树

测序结果上NCBI比对,有人说比对的结果看不出来什么,还是要建树,可是怎么建树啊
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vir2008

木虫 (著名写手)



zxy664063437(金币+1): 谢谢参与
用软件。
不很难,我们实验室有人做过。
2楼2012-11-15 14:36:31
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乐乐3952

铁杆木虫 (正式写手)



zxy664063437(金币+1): 谢谢参与
可以用mega,这个做进化树比较好,http://ishare.iask.sina.com.cn/f/34612576.html
3楼2012-11-15 15:13:30
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kingleo99

木虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
参考这个帖子,里面将系统进化树,序列提交,以及分析都给了分析。http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3590809
4楼2012-11-15 16:02:13
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吕好新

金虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
内容已删除
5楼2012-11-16 10:42:01
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吕好新

金虫 (小有名气)


内容已删除
6楼2012-11-16 10:42:32
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nancyyazi

铜虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
先用CLUSTAL比对,然后用MEGA建树。建树用的菌株序列可以从LPSN下载标准菌株序列

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7楼2012-11-16 11:22:04
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zxy664063437

新虫 (初入文坛)


送鲜花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by nancyyazi at 2012-11-16 11:22:04
先用CLUSTAL比对,然后用MEGA建树。建树用的菌株序列可以从LPSN下载标准菌株序列

是不是每个测序的菌株都要一个参考菌株啊
8楼2012-11-16 21:49:56
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黑藻先生

银虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
其实MEGA就可以直接比对的样子...................
所以一般一个MEGA就够了吧=。=
9楼2012-12-10 16:15:35
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