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sophiejoy

银虫 (小有名气)


[交流] 代谢通量分析中的通量是指什么呀?

看了好多文章关于代谢通量分析的 ,因为以前没有接触过所以不太明白,比如有个分别取发酵6、20、32h的数据(略)代入米根霉的通量模型进行计算,其通量分布结果如图
   我想知道这个通量到底是什么呀?是个物质的浓度,反应速率,还是其他的什么?另外,我是刚接触这方面的实验 以后课题就是这个了 ,哪位能推荐点代谢方面基础的书或者文献值了的,谢谢~

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看天

木虫 (知名作家)



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引用回帖:
8楼: Originally posted by sophiejoy at 2012-12-17 11:59:25
哦  明白了 但是我看的书上有说的是速率啊 利用矩阵Ar=X 来计算的话 A是各反应的化学计量系数矩阵,X是代谢物的净转化速率矩阵 r 就是通量  就是速率...

我在1楼的回复是针对你所给的图上的数据而言的。你涂上的数据都是以mol为单位的。
当然也可以用速率来表示,速率就是单位时间(或者说给定时间段)内的反应的量,此时只不过是所有数据都多了一个“/h"的单位。而且用速率的话,物质的的量往往也不是以葡萄糖为基准了,而是自身的实际的量。
9楼2012-12-17 15:55:08
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看天

木虫 (知名作家)


★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
wizardfan: 金币+2, 谢谢分享经验 2012-11-11 08:34:12
sophiejoy: 金币+10 2012-11-12 09:36:31
你是南林还是南工的:
通量是底物分配在各代谢途径上的反应的量,比如100mol的葡萄糖,用于几丁质的葡萄糖是3.67mol,向下进入F6P的是96.33mol
你给出的这种量是以葡萄糖的摩尔量为参考的(以100mol葡萄糖为设定用量),可以认为有多少葡萄糖这个6碳骨架用于该途径上的反应了,所以各个数值之和等于分支前流量,并且都不会大于最终的100mol。
有时还有一种不是以葡萄糖为基准的,而是以自身摩尔量为计算结果 如果一种物质一分为二 这个通量就一下子增大了2倍
因此通量反映的是产物的得率 而非速率
2楼2012-11-10 17:47:14
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★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
看天: 金币+3, 鼓励 2012-11-12 18:28:53
可以理解成百分比

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3楼2012-11-11 08:32:57
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sophiejoy

银虫 (小有名气)


引用回帖:
2楼: Originally posted by 看天 at 2012-11-10 17:47:14
你是南林还是南工的:
通量是底物分配在各代谢途径上的反应的量,比如100mol的葡萄糖,用于几丁质的葡萄糖是3.67mol,向下进入F6P的是96.33mol
你给出的这种量是以葡萄糖的摩尔量为参考的(以100mol葡萄糖为设定用 ...

谢谢~我明白了~
为什么这么确定我是南林或者南工的啊? 我是南林的。。。
4楼2012-11-12 09:40:07
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