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关于雄性不育基因的克隆,目前卡在5’3‘端
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xiaoxiao70
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关于雄性不育基因的克隆,目前卡在5’3‘端
我在克隆一个雄性不育相关基因,中间片段已经通过同源性设计的引物克隆得到,现在在用染色体步移的方法去克隆两端,用的是宝生物的genome walking的试剂盒,每次二三次pcr出来的丰度不是很大,但是可以切胶回收得到。然后送去测序,总是没有结果。
附测序公司的回信:
您的PCR样品5’(2),3’(2)(使用相对应的引物)测序后发现有重叠现象,我们怀疑是由以下几个方面的原因造成的:
1.已纯化的PCR样品造成这种情况的原因是由于模板纯化有一定问题,模板中含有非特异性的条带;
2.如果是未纯化的PCR产物,那么有可能是您要求测序的片段周围含有大小相近的条带,我们通过琼脂糖凝胶回收,无法有效切除这种大小差别不是很明显的条带;
3.模板或是引物质量较差,测序反应结束之后没有产生足够的目的产物,导致测序信号较弱,杂背景较高,形成重叠现象。
这些原因都可能造成PCR样品测序之后出现重叠现象.建议您改进后重新进行测序。
附图是三次pcr 1%琼脂糖凝胶电泳全部点样后的图。
5\' 123 2012-9-11.jpg
3\' 123 2012-9-19.jpg
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2012-11-09 16:40:48
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第一张图是5’端,从左到右分别是marker,一次二次三次pcr;第二张图是3‘端,从左到右分别是marker,一次二次三次pcr。
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2楼
2012-11-09 16:42:58
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xiaoxiao70
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希望大家帮下忙,谢谢啦!
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2012-11-09 16:43:25
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性别: GG
专业: 作物杂种优势及其利用
我也即将做这方面的,求交流。
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生活就是享受,好好享受着活着。
4楼
2012-11-30 11:01:04
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