应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » DS 跑着跑着到了15个小时，cpu利用率变为1%-5%。怎么回事？
51/1返回列表
查看: 774  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

zhouzhiguang

金虫 (小有名气)

[求助] DS 跑着跑着到了15个小时，cpu利用率变为1%-5%。怎么回事？

我在用DS跑一个MD,第二天早上（共跑了15个小时左右）去看的时候发现CPU利用率变为了很小，昨天晚上还是100%的啊。我不知道怎么回事，只能把MD STOP了的。请教怎么回事？ 时间实在是耽误不起啊。
注：我用的DS2.5.5win版，机子是酷睿四核。设置时number of processors：4.
是不是程序不稳定，还是怎么的？有什么解决措施吗？
回复此楼

» 猜你喜欢
让我们high起来！
1楼 2012-11-08 13:28:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yaozhq

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-11-09 09:14:30
你应该等一下观察一下记录文件 ds的动力学做的不是很完美 有时候会出各种问题 而且最好在linux下跑 win下很容易内存溢出 然后就慢到死
赞一下 回复此楼
2楼2012-11-08 13:51:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhouzhiguang

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yaozhq at 2012-11-08 13:51:58
你应该等一下观察一下记录文件 ds的动力学做的不是很完美 有时候会出各种问题 而且最好在linux下跑 win下很容易内存溢出 然后就慢到死

内存是8个G的（加了一内存条），使用率一般不超过50%
赞一下 回复此楼
让我们high起来！
3楼2012-11-08 20:12:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yaozhq

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-11-17 15:47:38
引用回帖:
3楼: Originally posted by zhouzhiguang at 2012-11-08 20:12:32
内存是8个G的（加了一内存条），使用率一般不超过50%...

那是因为ds只能用4G内存………… 别问我为什么 即使是64位linux版本也有这样的问题 内存吃掉3.99G然后卡死
赞一下 回复此楼
4楼2012-11-17 12:28:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yaozhq

金虫 (小有名气)
★
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-11-17 15:47:49
引用回帖:
4楼: Originally posted by yaozhq at 2012-11-17 12:28:45
那是因为ds只能用4G内存………… 别问我为什么 即使是64位linux版本也有这样的问题 内存吃掉3.99G然后卡死...

可能是模块有部分还是32位编译的 导致的问题吧 不懂 商业化软件没法深入研究的  总之方便的代价就是这样 内部的细节都被掩盖了 对错你都不知道 就只能看结果
赞一下 回复此楼
5楼2012-11-17 12:31:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zhouzhiguang 的主题更新
51/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分？ +11 yufeiwaner 2026-08-09 12/600 2026-08-12 01:27 by 南京中西医
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +17 Lanmanbaby 2026-08-09 29/1450 2026-08-12 00:24 by zhanghaozhu
[基金申请] 奇怪，两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +7 布布和一二 2026-08-10 9/450 2026-08-11 22:12 by 医学老男孩
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的，真有人买论文么？感觉没必要啊 +8 Tide man 2026-08-10 9/450 2026-08-11 20:39 by beefly
[基金申请] 有时候，自然基金真的不能太认真 （我的申报经验） +3 majunge000 2026-08-11 4/200 2026-08-11 20:13 by lch2012
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 什么时候出结果，有咨询渠道？？？ +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 听说今天filecode变了 +26 布布和一二 2026-08-06 49/2450 2026-08-11 13:18 by WH3796
[基金申请] filecode +9 documentary 2026-08-10 9/450 2026-08-11 10:08 by wk7465
[基金申请] 确定了，国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] fileCode有新解读？ +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode，很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制，评价高的钱多评价低的钱少，但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[基金申请] 好消息？这个有何含义？？？ +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭