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aspect3000至尊木虫 (知名作家)
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[交流]
学习autodock中的ADT使用问题？
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我在学习autodock中的ADT使用Exercise Six: Starting AutoGrid 4 对下列的要求理会不深，您能给讲讲吗？我按练习做，ADT没有任何反应的，您能作个使用ADT演示？ 另外autodock不在ADT下，也可以运行吗？那是如何运行的？（最好是WINDOWS界面） In general you should know: 1.AutoGrid 4 (and AutoDock 4) must be run in the directories where the rigid macromolecule, ligand and parameter files are to be found. 2. The named files in the parameter file must not include pathnames. 3. Currently, it is not possible to run either program on a WINDOWS platform except in a cygwin shell. |
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3楼2007-06-30 16:18:27
alwens
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可乐=枫(金币+1):3Q
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报告这个错误是adt找不到autogrid4和autodock4的执行程序 adt只是一个作准备文件和查看对接结果的工具 它还需要外部调用autogrid和autodock 你需要先去下载windows版本的autogrid4和autodock4 http://autodock.scripps.edu/downloads 然后在Run->Run Autogrid(Autodock)菜单下指明你下载的两个执行文件放置的目录 注意：最好不要在目录名中有中文或空格（不知道这个bug现在解决了没有） 然后运行就可以了。 ps：autogrid4和autodock4都是支持命令行提交任务的 对于你使用adt产生的***.gpf和***.dpf可以直接使用命令行 做完了再用adt看结果，一样的。 lz好运！：） |
2楼2007-06-30 10:22:22