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灯泡3204

木虫 (著名写手)

[求助] 绝对构型问题

结构中没有重原子，mo靶，单晶只能给出相对构型，后来我用其他方法确定了绝对构型，我在画ORTEP时，如何画成确定的绝对构型？

而且在确定绝对构型之前已经申请了CCDC号，现在绝对构型定下来之后是否要重新申请CCDC号？
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灯泡3204

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1楼 2012-11-05 20:17:23
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luxtal

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
linhua0402313: 金币+1, 感谢回帖交流，欢迎常来晶体板块 2012-11-06 08:11:36
灯泡3204: 金币+2, 感谢指导 2012-11-06 17:06:54
请问你是如何确定用于单晶衍射的那个晶体的绝对够型的？有用不同的X射线衍射？貌似没有其它办法。
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What_we_observe_is_not_nature_itself,_but_nature_exposed_to_our_method_of_questioning----Werner_Karl_Heisenberg
2楼2012-11-06 00:28:48
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★
linhua0402313: 金币+1, 感谢回帖交流，欢迎常来晶体板块 2012-11-06 08:11:42
如果其他方法确定了绝对构型，而原来结构精修时用的是另外一种构型，则应进行结构翻转后，重新精修到收敛，结束，才可以。
CCDC号不用重新申请，但要去信，发送新数据替代。
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xi2004-emuch@163.com
3楼2012-11-06 08:06:35
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灯泡3204

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by luxtal at 2012-11-06 00:28:48
请问你是如何确定用于单晶衍射的那个晶体的绝对够型的？有用不同的X射线衍射？貌似没有其它办法。

用的是改良的Mosher法，你的意思就是说只要不是X-Ray，现在的情况就不能在晶体解析时确定绝对构型，是吧？
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4楼2012-11-06 08:07:22
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灯泡3204

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by xi2004 at 2012-11-06 08:06:35
如果其他方法确定了绝对构型，而原来结构精修时用的是另外一种构型，则应进行结构翻转后，重新精修到收敛，结束，才可以。
CCDC号不用重新申请，但要去信，发送新数据替代。

感谢xi2004老师，前段时间帮我解析了无序结构，
结构反转我还不会，我先在小范围请教一下，如果不能完美解决，还请xi2004老师帮忙，这个是结构与上次您帮我解决的是类似物，谢谢！
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5楼2012-11-06 08:11:47
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灯泡3204

木虫 (著名写手)
送鲜花一朵
感谢xi2004老师帮我解决了这个问题，谢谢！
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6楼2012-11-06 17:08:19
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sigmax

银虫 (正式写手)
如果是有机化合物，可以用偏振圆二色（VCD， 偏振红外）的方法鉴别手性中心的绝对构型。

原理很简单，实测偏振红外谱，然后用gaussian计算其VCD谱。如果一致，则假设的绝对构型正确；如果不一致（实际上是强度反转），则绝对构型改为其对映异构构象。

也可以用二维核磁，不同绝对构型的原子间相互距离不同。
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7楼2012-11-07 20:40:20
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灯泡3204

木虫 (著名写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by sigmax at 2012-11-07 20:40:20
如果是有机化合物，可以用偏振圆二色（VCD， 偏振红外）的方法鉴别手性中心的绝对构型。

原理很简单，实测偏振红外谱，然后用gaussian计算其VCD谱。如果一致，则假设的绝对构型正确；如果不一致（实际上是强度反 ...

我用过计算CD判断绝对构型，后来也看过别人用计算VCD来判断！
VCD是不是比CD更靠谱些！？
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8楼2012-11-08 17:21:37
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