| 查看: 706 | 回复: 3 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
克隆后所得到的结果序列比较多，相同的序列或差异性小于0.01有没有软件自动鉴别出来
|
||
|
做了PCR克隆测序，有6个克隆文库，每个克隆文库里面有大概测序90个。这样得到很多的序列。想问有没有什么软件可以筛选淘汰掉一些序列或者把一些类似差不多的序列划到一起。因为MEGA建树的时候觉得这么多的序列建树起来很庞大而且有大部分的序列进化距离基本为0，也没有必要。 用过DOTUR计算所得序列的OTU，比如怎么筛选掉相似度差异小于0.01或者0.03的序列。或者这样的序列是不是可以把它作为一种基因类型来建树。 所以试问有没有某种软件把差异小于0.01或者0.03的序列自动划在一起，可以清晰的鉴别出来。难道只能用cluster W或者DNAMAN来比对一个一个比对来鉴别？ |
回复此楼» 猜你喜欢
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有224人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
-
纳米粒度分析
已经有3人回复
-
林科院林化所招收材料与化工专业硕士，坐标南京
已经有0人回复
4楼2020-04-10 20:46:25
yalong
木虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2188
- 散金: 2
- 帖子: 170
- 在线: 119.4小时
- 虫号: 1225018
- 注册: 2011-03-08
- 性别: GG
- 专业: 土壤生态学
2楼2012-12-05 15:24:10
3楼2013-06-24 11:10:32
