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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 有哪位熟悉NCBI的高手，求教，本人第一次接触，一片迷茫
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wu_shiyong

银虫 (正式写手)
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10楼: Originally posted by yatou99 at 2012-11-08 09:50:56
我重新搜索了，主要是搜到的是整个染色体上全基因很长，我的那个酶的DNA序列大概只有1500个左右，都不知道从哪里开始是我需要的那个酶的序列，现在就只搜到从ccds数据库直接找到两个不同生物表达那个酶的序列，其他 ...

收索出来的整个基因组序列里面查找你需要的酶，会出现产物是你那个酶的基因和他的CDS区，你直接打开基因就有序列啦！还有你是做原核表达用的吗?
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低调稳重务实内敛---------------残
11楼2012-11-08 09:56:33
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yatou99

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
11楼: Originally posted by wu_shiyong at 2012-11-08 09:56:33
收索出来的整个基因组序列里面查找你需要的酶，会出现产物是你那个酶的基因和他的CDS区，你直接打开基因就有序列啦！还有你是做原核表达用的吗?...

素我愚昧，嘿嘿，还是不太懂，暂时不做原核表达
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12楼2012-11-08 11:18:32
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wu_shiyong

银虫 (正式写手)
引用回帖:
12楼: Originally posted by yatou99 at 2012-11-08 11:18:32
素我愚昧，嘿嘿，还是不太懂，暂时不做原核表达...

你可以把基因名和物种名发过来我跟你找！
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低调稳重务实内敛---------------残
13楼2012-11-08 12:07:02
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yatou99

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
13楼: Originally posted by wu_shiyong at 2012-11-08 12:07:02
你可以把基因名和物种名发过来我跟你找！...

CYP7A或者CYP7A1，很多动物包括人类都会有这个酶的，我现在是不限定是哪个物种，我们现在筛到的是微生物，数据库里大多数都是动物的基本没微生物的，麻烦您帮我看看能找到多几个固然好，找不到也没关系滴，呵呵，谢啦！
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14楼2012-11-08 14:44:28
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一品永远
15楼2012-11-08 15:17:35
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wu_shiyong

银虫 (正式写手)
引用回帖:
14楼: Originally posted by yatou99 at 2012-11-08 14:44:28
CYP7A或者CYP7A1，很多动物包括人类都会有这个酶的，我现在是不限定是哪个物种，我们现在筛到的是微生物，数据库里大多数都是动物的基本没微生物的，麻烦您帮我看看能找到多几个固然好，找不到也没关系滴，呵呵，谢 ...

sorry，我也只找到的是动物的！但是这个东西这个东西微生物里面有吗？
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低调稳重务实内敛---------------残
16楼2012-11-08 19:33:22
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天虫侠

新虫 (初入文坛)
小丹木木: 应助指数-1, 这个不算应助了 2012-11-09 14:17:59
关注中，本人也第一次接住
一个月了，还不知怎么用
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17楼2012-11-08 20:44:56
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天虫侠

新虫 (初入文坛)
小丹木木: 应助指数-1, 这个不算应助哦 2012-11-09 14:18:19
出现一大推的AT/////怎么分析，现急！！！！！！！


还有图表怎么看？？？？？？？？？？
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18楼2012-11-08 20:45:58
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sunshinewzy

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-11-09 14:18:28
yatou99: 金币+10, ★★★很有帮助 2012-11-14 23:08:31
我在NCBI上搜DNA序列是先查关于目标基因的引物的文献（在pubmed的搜索框里直接输入种属、基因名和primers就行），文献中有对应该基因的引物序列，拿这个序列到核酸blast中搜索，注意选择种属，如果文献中引物没问题的话一般就能找到想找的基因~
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19楼2012-11-08 20:50:12
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yatou99

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
16楼: Originally posted by wu_shiyong at 2012-11-08 19:33:22
sorry，我也只找到的是动物的！但是这个东西这个东西微生物里面有吗？...

有的，现在我就是想找多几个动物的那个酶序列然后找保守序列设计引物，就这样
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20楼2012-11-08 23:20:25
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