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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 化学化工区 » 分析 » 化学分析 » 关于G-四联体
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2592lantaoyu

银虫 (小有名气)

[求助] 关于G-四联体

因要用合成的席夫碱铜化合物检测G-四联体，第一次触碰，请教下，对这G-四联体，有何要求吗？就是说我该用怎样的G-四联体呢？
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呵呵
1楼 2012-11-03 20:39:05
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greeneese

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
crity328: 金币+1, 感谢交流，欢迎常来！ 2012-11-04 18:24:45
如果你说的是DNA的G-quadruplex，那么这指的是一条含有很多个G碱基的寡聚脱氧核苷酸链，典型的比如这种序列

5‘-GGTGGTGGTGGTTGTGGTGGTGGTGG-3’
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2楼2012-11-04 15:11:25
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2592lantaoyu

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by greeneese at 2012-11-04 15:11:25
如果你说的是DNA的G-quadruplex，那么这指的是一条含有很多个G碱基的寡聚脱氧核苷酸链，典型的比如这种序列

5‘-GGTGGTGGTGGTTGTGGTGGTGGTGG-3’

那再问下，做测试时，DNA的浓度一般是0到多少M 哦？因为我的化合物的浓度是2ouM，不然紫外就测试部到了。。我们购买时不是最大浓度就是10-4M不，需要量不是要很大？？。。还有，已经买好的G4我们还需要再按An intramolecular G-quadruplex was prepared by
incubating oligonucleotide G4A1 [5′-CATGGTGGTTT-
(GGGTTA)4CCAC-3′] containing four human telomeric sequences
in Tris/KCl buffer, which was heated to 95 °C for 10
min and then cooled to room temperature overnight.这个条件合成不？
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呵呵
3楼2012-11-05 16:48:58
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greeneese

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 2592lantaoyu at 2012-11-05 16:48:58
那再问下，做测试时，DNA的浓度一般是0到多少M 哦？因为我的化合物的浓度是2ouM，不然紫外就测试部到了。。我们购买时不是最大浓度就是10-4M不，需要量不是要很大？？。。还有，已经买好的G4我们还需要再按An intr ...

1 这个描述称不上是合成，这只是把买来的DNA链通过加热和退火处理，确保其能够最大限度的形成G-quadruplex而已。这个操作时应该的。

2 理论上G-quadruplex及其配位中心体的浓度应该是匹配的，就是说G-quadruplex的浓度也应该在20 μM左右。
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4楼2012-11-08 07:11:51
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2592lantaoyu

银虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by greeneese at 2012-11-08 07:11:51
1 这个描述称不上是合成，这只是把买来的DNA链通过加热和退火处理，确保其能够最大限度的形成G-quadruplex而已。这个操作时应该的。

2 理论上G-quadruplex及其配位中心体的浓度应该是匹配的，就是说G-quadruple ...

好几天了，关于G四联体现在才明白那么一点点。还被老板痛批！。不过现在还是有点不明白的就是我购买的时候需要多少OD的G-四联体，比如我的G-四联体5′-CATGGTGGTTTGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTACCAC-3′ 的碱基数是39，生工的说  这条链大概加40ul溶解1od的量，浓度大概0.1mMol的。需重新算下需要多少od，所谓的od怎么算呢？
然后一个碱基是一块五，我希望我的原始浓度能够达到10-2M，需要多少量的DNA合在一管中， 才能达到原始浓度的要求？这样的话需要考虑DNA的溶解度问题吗？
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呵呵
5楼2012-11-08 15:17:40
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greeneese

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by 2592lantaoyu at 2012-11-08 15:17:40
好几天了，关于G四联体现在才明白那么一点点。还被老板痛批！。不过现在还是有点不明白的就是我购买的时候需要多少OD的G-四联体，比如我的G-四联体5′-CATGGTGGTTTGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTACCAC-3′ 的碱基数 ...

1 OD的寡聚核苷酸链相当于33 μg。根据序列可以计算出摩尔质量（摩尔质量的数字也应该在寡聚核苷酸链的合成单上说明）。然后根据质量、摩尔质量和溶液体积算浓度。

顺便说一句，让寡聚核苷酸浓度达到10-2 M不太现实。
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6楼2012-11-09 07:18:27
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2592lantaoyu

银虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by greeneese at 2012-11-09 07:18:27
1 OD的寡聚核苷酸链相当于33 μg。根据序列可以计算出摩尔质量（摩尔质量的数字也应该在寡聚核苷酸链的合成单上说明）。然后根据质量、摩尔质量和溶液体积算浓度。

顺便说一句，让寡聚核苷酸浓度达到10-2 M不太 ...

可以再具体点不？用我所列出的那序列的 核苷酸并用数字解释不？真的不懂啊？OD的大小还是不会算
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呵呵
7楼2012-11-09 09:11:24
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