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2592lantaoyu

银虫 (小有名气)

[求助] 关于G-四联体

因要用合成的席夫碱铜化合物检测G-四联体,第一次触碰,请教下,对这G-四联体,有何要求吗?就是说我该用怎样的G-四联体呢?
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呵呵
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greeneese

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
crity328: 金币+1, 感谢交流,欢迎常来! 2012-11-04 18:24:45
如果你说的是DNA的G-quadruplex,那么这指的是一条含有很多个G碱基的寡聚脱氧核苷酸链,典型的比如这种序列

5‘-GGTGGTGGTGGTTGTGGTGGTGGTGG-3’
2楼2012-11-04 15:11:25
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2592lantaoyu

银虫 (小有名气)

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2楼: Originally posted by greeneese at 2012-11-04 15:11:25
如果你说的是DNA的G-quadruplex,那么这指的是一条含有很多个G碱基的寡聚脱氧核苷酸链,典型的比如这种序列

5‘-GGTGGTGGTGGTTGTGGTGGTGGTGG-3’

那再问下,做测试时,DNA的浓度一般是0到多少M 哦?因为我的化合物的浓度是2ouM,不然紫外就测试部到了。。我们购买时不是最大浓度就是10-4M不,需要量不是要很大??。。还有,已经买好的G4我们还需要再按An intramolecular G-quadruplex was prepared by
incubating oligonucleotide G4A1 [5′-CATGGTGGTTT-
(GGGTTA)4CCAC-3′] containing four human telomeric sequences
in Tris/KCl buffer, which was heated to 95 °C for 10
min and then cooled to room temperature overnight.这个条件合成不?
呵呵
3楼2012-11-05 16:48:58
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greeneese

铁杆木虫 (正式写手)

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3楼: Originally posted by 2592lantaoyu at 2012-11-05 16:48:58
那再问下,做测试时,DNA的浓度一般是0到多少M 哦?因为我的化合物的浓度是2ouM,不然紫外就测试部到了。。我们购买时不是最大浓度就是10-4M不,需要量不是要很大??。。还有,已经买好的G4我们还需要再按An intr ...

1 这个描述称不上是合成,这只是把买来的DNA链通过加热和退火处理,确保其能够最大限度的形成G-quadruplex而已。这个操作时应该的。

2 理论上G-quadruplex及其配位中心体的浓度应该是匹配的,就是说G-quadruplex的浓度也应该在20 μM左右。
4楼2012-11-08 07:11:51
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2592lantaoyu

银虫 (小有名气)

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4楼: Originally posted by greeneese at 2012-11-08 07:11:51
1 这个描述称不上是合成,这只是把买来的DNA链通过加热和退火处理,确保其能够最大限度的形成G-quadruplex而已。这个操作时应该的。

2 理论上G-quadruplex及其配位中心体的浓度应该是匹配的,就是说G-quadruple ...

好几天了,关于G四联体现在才明白那么一点点。还被老板痛批!。不过现在还是有点不明白的就是我购买的时候需要多少OD的G-四联体,比如我的G-四联体5′-CATGGTGGTTTGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTACCAC-3′ 的碱基数是39,生工的说  这条链大概加40ul溶解1od的量,浓度大概0.1mMol的。需重新算下需要多少od,所谓的od怎么算呢?
然后一个碱基是一块五,我希望我的原始浓度能够达到10-2M,需要多少量的DNA合在一管中, 才能达到原始浓度的要求?这样的话需要考虑DNA的溶解度问题吗?
呵呵
5楼2012-11-08 15:17:40
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greeneese

铁杆木虫 (正式写手)

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5楼: Originally posted by 2592lantaoyu at 2012-11-08 15:17:40
好几天了,关于G四联体现在才明白那么一点点。还被老板痛批!。不过现在还是有点不明白的就是我购买的时候需要多少OD的G-四联体,比如我的G-四联体5′-CATGGTGGTTTGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTACCAC-3′ 的碱基数 ...

1 OD的寡聚核苷酸链相当于33 μg。根据序列可以计算出摩尔质量(摩尔质量的数字也应该在寡聚核苷酸链的合成单上说明)。然后根据质量、摩尔质量和溶液体积算浓度。

顺便说一句,让寡聚核苷酸浓度达到10-2 M不太现实。
6楼2012-11-09 07:18:27
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2592lantaoyu

银虫 (小有名气)

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6楼: Originally posted by greeneese at 2012-11-09 07:18:27
1 OD的寡聚核苷酸链相当于33 μg。根据序列可以计算出摩尔质量(摩尔质量的数字也应该在寡聚核苷酸链的合成单上说明)。然后根据质量、摩尔质量和溶液体积算浓度。

顺便说一句,让寡聚核苷酸浓度达到10-2 M不太 ...

可以再具体点不?用我所列出的那序列的 核苷酸并用数字解释不?真的不懂啊?OD的大小还是不会算
呵呵
7楼2012-11-09 09:11:24
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