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xtmgah31

银虫 (小有名气)

[交流] 变性梯度凝胶电泳染色

我在文献中看到:DGGE电泳结束后用50μg/m l 溴乙锭/1 ×TA E 染色10 分钟,再用1×TA E 缓冲液浸泡5 分钟退去部分杂色后, 使用GelDoc 1000 紫外检测系统观察电泳结果。
染色时1×TAE的作用是什么呢?它退色的原理又是什么呢?溴化乙锭的浓度对染色效果有很大的影响吗?please help me!
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tuotuozw

银虫 (小有名气)


johnsooh(金币+1):thanks
DGGE最常用的几种染色方法是溴化乙啶(ethidium bromide, EB),SYBR Green I, SYBR Gold和银染法。EB 法染色的灵敏度最低。SYBR Green I 和 SYBR Gold 相比 EB,能更好地消除染色背景,因此它们的检测灵敏度比 EB 法高很多。EB 和 SYBR 染色时,双链 DNA 能很好地显色,单链 DNA 基本上不能显色。银染法的灵敏度最高,它不但能染双链 DNA,也能染单链 DNA,但它的缺点是不能用于随后的杂交分析。

聚丙烯酰胺凝胶背景会很容易加深,吸附较多的EB引起核酸荧光的悴灭,因此要用水或缓冲液来退去凝胶上多余的EB,利用1X的TAE为了维持一定的渗透压,使核酸带型更紧凑。其实水洗的更快,但影响美观的。
2楼2007-06-28 23:40:12
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