24小时热门版块排行榜    

查看: 1035  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

微笑生活

铜虫 (小有名气)

[求助] 有做过基因预测的朋友吗

用各种软件把基因预测出来后,进一步注释功能,可是有很多杂乱的序列需要筛除,这个要怎么做呢,因为预测出来的基因太多了,筛过一遍还是留下很多
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

微笑生活

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by xj8442cn at 2012-11-14 00:10:09
有整合软件如Maker PASA等,但是这些软件也有问题,比如MAKER会删除很多实际存在的基因。

看来你有经验啊
对于partial sequences,不知道该怎么处理呢
我看到有文献对于短于80%或者多少的序列进行删除,
可那样也会删掉一些本来存在的基因
10楼2012-11-14 17:40:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
微笑生活: 金币+10, 有帮助 2012-11-05 21:35:12
不同软件都有一定的正确率,像这种情况下,一般使用consensus结果。
2楼2012-10-31 08:12:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

robertorun

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
微笑生活: 金币+10 2012-11-05 21:35:35
evm或glean等整合

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
3楼2012-11-03 12:31:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

微笑生活

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wizardfan at 2012-10-31 08:12:04
不同软件都有一定的正确率,像这种情况下,一般使用consensus结果。

谢谢,但是可能我表达得不清楚,我想问的是怎样筛除预测出来的基因中那些假阳性的序列
4楼2012-11-05 21:34:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿哈工大,085400,320,求调剂 +4 gdlf9999 2026-03-24 4/200 2026-03-25 23:01 by boxking200
[考研] 考研调剂 +6 来好运来来来 2026-03-21 7/350 2026-03-25 22:43 by 418490947
[考研] 299求调剂 +7 某某某某位 2026-03-21 8/400 2026-03-25 20:34 by 热情沙漠
[考研] 生物技术与工程 +3 1294608413 2026-03-25 4/200 2026-03-25 18:02 by 1294608413
[考研] 296求调剂 +4 汪!?! 2026-03-25 7/350 2026-03-25 16:41 by 汪!?!
[考研] 333求调剂 +6 87639 2026-03-21 11/550 2026-03-25 16:17 by 87639
[考研] 085602 289分求调剂 +7 WWW西西弗斯 2026-03-24 7/350 2026-03-25 14:28 by 3Strings
[考研] 284求调剂 +15 Zhao anqi 2026-03-22 15/750 2026-03-25 12:51 by wht0531
[考研] 282求调剂 +3 wcq131415 2026-03-24 3/150 2026-03-25 12:16 by userper
[考研] 281求调剂 +4 Koxui 2026-03-24 5/250 2026-03-25 11:38 by userper
[考研] 化学调剂 +6 yzysaa 2026-03-21 6/300 2026-03-25 09:27 by aa331100
[考研] 食品专硕 一志愿双一流 328 +3 xiaom99 2026-03-21 4/200 2026-03-24 21:20 by lailaisimei
[考研] 0856材料专硕353求调剂 +6 NIFFFfff 2026-03-20 6/300 2026-03-24 21:02 by hello七七
[考研] 材料考研调剂生 +3 黄粱一梦千年 2026-03-24 3/150 2026-03-24 17:00 by barlinike
[考研] 求调剂一志愿武汉理工大学材料工程(085601) +5 WW.' 2026-03-23 7/350 2026-03-24 14:50 by sprinining
[基金申请] 请教下大家 2026年国家基金申请是双盲审吗? +3 lishucheng1 2026-03-22 5/250 2026-03-24 08:22 by gltch
[考研] 284求调剂 +3 yanzhixue111 2026-03-23 6/300 2026-03-23 22:58 by pswait
[考研] 材料与化工085600,总分304,本科有两篇sci参与,求调剂 +4 幸运的酱酱 2026-03-22 5/250 2026-03-22 20:15 by edmund7
[考研] 332求调剂 +3 凤凰院丁真 2026-03-20 3/150 2026-03-21 10:27 by luoyongfeng
[考研] 求调剂 +3 eation27 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:32 by JourneyLucky
信息提示
请填处理意见