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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » MS中的问题
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majiejili

金虫 (小有名气)

[求助] MS中的问题

我测试一下这个金和有机分子末端H的接触方式，请问在MS中应该用哪个模块，我用Dmol3结果run是灰色的，请大家指教

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好好科研
1楼 2012-10-29 09:39:12
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才
引用回帖:
2楼: Originally posted by jiewei at 2012-10-29 16:25:51
你MS的版本是？  5.5以下的版本MS中dmol是不能处理周期结构的
看你好像是做了表面修改的Au。
Au的话最好还是用castep比较好。 dmol对于赝势处理不如castep

你是一个周期结构在cleave  surface之后的结构，这个结构dmol不认识，所以不能run，所以你需要重新建立一个空晶胞，楼下已经有人回复了...
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我想做个科学家，可我又喜欢写诗；我想做一个诗人，可我却读的理工科..
6楼2012-10-30 08:51:55
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
majiejili: 金币+10, ★★★很有帮助, 我用的是5.5，我把这个结构放在MS里run这个按钮不能算，是灰的，请问一下问什么？谢谢你的回答 2012-10-29 18:22:35
你MS的版本是？  5.5以下的版本MS中dmol是不能处理周期结构的
看你好像是做了表面修改的Au。
Au的话最好还是用castep比较好。 dmol对于赝势处理不如castep
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我想做个科学家，可我又喜欢写诗；我想做一个诗人，可我却读的理工科..
2楼2012-10-29 16:25:51
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ice_rain

铁杆木虫 (正式写手)
你这个结构是二维结构吧，如果三维结构，好像没有建没有建真空层。
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3楼2012-10-29 16:31:29
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majiejili

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by ice_rain at 2012-10-29 16:31:29
你这个结构是二维结构吧，如果三维结构，好像没有建没有建真空层。

是三维结构，我是优化一下分子和这个金的距离，请问怎么建真空层
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好好科研
4楼2012-10-29 18:20:13
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