应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » Gaussion 加水进行优化计算出错，求高手进来看看啊，感激不尽,焦急阿
61/1返回列表
查看: 716  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

fight1man

金虫 (小有名气)

[求助] Gaussion 加水进行优化计算出错，求高手进来看看啊，感激不尽,焦急阿

一样的输入文件算法,但是对单体A和B分别计算错误不成功，奇怪的是，而对通过AUTODOCK对接得到的A和B的结合物C能计算成功，非常纳闷之中，请高手指点谢谢
附上输入文件
%chk=D:\xy\lv\danti\DMCDPM3h2o.chk
%mem=500MB
%rwf=d:\1,500mb,d:\2,500mb,d:\3,500mb,d:\4,500mb,d:\5,500mb
# hf scrf=(ipcm,solvent=water) geom=connectivity
和出错的输出文件[ Last edited by fight1man on 2012-10-25 at 14:51 ]
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : BCDh2o.out
    • 2012-10-25 13:12:33, 60.26 K
  • 附件 2 : BCDh2o.gjf
    • 2012-10-25 13:21:11, 11.51 K
  • 附件 3 : DM1010g2.out
    • 2012-10-25 14:51:02, 64.05 K

» 猜你喜欢
1楼 2012-10-25 13:16:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cxyuan09

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+3 2012-10-26 12:20:38
fight1man: 金币+25, ★有帮助 2012-10-28 19:32:57
1、出错原因
(1)、BCDho.out
这个是自洽场(SCF)迭代不收敛，很多时候不太容易解决，可参照本版置顶帖Gaussian FAQ的2.3节的相关内容来解决。
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1566146
(2)、DM1010g2.out
这个是IPCM溶剂模型计算中迭代不收敛。
可以在关键词那一行（#打头）添加IOP(1/6=N)来解决，默认N=200，你的输出文件就是200循环还没有收敛出错。你可以设置的大一点。

2、建议。
你使用的计算方法(hf)太粗错，使得计算容易出各种问题。
你的体系应该是一个客体分子进入到环糊精的腔体中，属于弱相互作用，hf方法处理的实在是太差了，可以使用专用的处理弱相互作用的方法，比如B97D。
另外基组没有指定的话是使用sto-3g，也太粗糙，应该弱相互作用应该有极化函数（比如6-31G*），最好也有弥散函数(比如6-31+G*)。
即：建议使用B97D/6-31G*或者B97D/6-31+G*。不过你的体系有点大，带了加号算不动，先用前一种方法试试看吧。
赞一下 回复此楼
2楼2012-10-25 20:16:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2012-10-26 12:20:43
fight1man: 金币+25, ★有帮助, 谢谢啊，看来我得换理论方法基组看看了。可是我的体系要加水溶剂模型，您觉得我用哪个理论方法算比较合适啊。谢谢 2012-10-28 19:32:42
你的问题出在IPCM溶剂模型计算中迭代不收敛。而且从 Iteration number XXX MaxDiff 后面的数值可以看出，越迭代距离收敛限越远，所以增加迭代次数是徒劳。
如果没有特别要求必须使用IPCM模型的话，建议将IPCM关键词改为PCM。

你计算时使用的理论方法和基组明显不合适，这在LS已经提到了。但这并非是导致出错的原因。
赞一下 回复此楼
3楼2012-10-25 23:41:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fight1man

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by cxyuan09 at 2012-10-25 20:16:28
1、出错原因
(1)、BCDho.out
这个是自洽场(SCF)迭代不收敛，很多时候不太容易解决，可参照本版置顶帖Gaussian FAQ的2.3节的相关内容来解决。
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1566146
(2)、DM1010g2.o ...

嗯，谢谢您的回复，因为我想用水溶剂模型，它的算法不是有限制吗，所以我先选了HF 本来想用DFT的 但是太耗时 时间不是很宽裕
我想问下您说的B97D可以加溶剂水吗，我这个体系有这个算法 一般大概需要多少时间啊 谢谢
赞一下 回复此楼
4楼2012-10-28 19:28:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fight1man

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by cxyuan09 at 2012-10-25 20:16:28
1、出错原因
(1)、BCDho.out
这个是自洽场(SCF)迭代不收敛，很多时候不太容易解决，可参照本版置顶帖Gaussian FAQ的2.3节的相关内容来解决。
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1566146
(2)、DM1010g2.o ...

词那一行（#打头）添加IOP(1/6=N)来解决，默认N=200，尝试了不行。 理论方法换成B97D 加水溶剂模型 还是出错
赞一下 回复此楼
5楼2012-10-28 19:57:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fight1man

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by sobereva at 2012-10-25 23:41:40
你的问题出在IPCM溶剂模型计算中迭代不收敛。而且从 Iteration number XXX MaxDiff 后面的数值可以看出，越迭代距离收敛限越远，所以增加迭代次数是徒劳。
如果没有特别要求必须使用IPCM模型的话，建议将IPCM关键词 ...

换成了PCM模型 还是出错哈
赞一下 回复此楼
6楼2012-10-28 19:58:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 fight1man 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭